花椒叶锈病是花椒叶部的重要病害，可引起椒树叶子提前大量脱落，从而导致椒树再次萌发新叶。这样不仅影响了当年椒树的营养积累，重要的是因二次发叶消耗大量养分，直接影响翌年花椒的产量和品质，更重要的是对花椒树的寿命有很大的威胁。
花椒叶锈病主要为害叶片。叶片染病叶背面现黄色、裸露的夏孢子堆，大小0.2-0.4mm，圆形至椭圆形，包被破裂后变为橙黄色，后又褪为浅黄色，在与夏孢子堆对应的叶正面现红褐色斑块，秋后又形成冬孢子堆，圆形，大小0.2-0.7mm，橙黄色至暗黄色，严重时孢子堆扩展至全叶。
综合防治有三步：
（1）提早防治。在发病前喷1次索利巴尔溶液。
（2）及时防治。发病盛期每隔10天喷1次索利巴尔和吡虫啉农药。喷药时，注意在叶背、叶面及树干上都喷上农药，同时，还可防治花椒白粉病、烟煤病、蚜虫、红蜘蛛等病虫害。
（3）落叶杂草，集中烧毁，减少菌源。
一是人工防治。
①栽培抗病品种。可用狗椒等抗病品种与大红袍等染病品种混合栽种。还可通过无性繁殖或嫁接等方法培养抗病品种。
②加强肥水管理，增强树势，提高椒树自身的抗病能力。
③清园。花椒落叶之后，将病枝落叶进行清扫，集中烧毁，和消灭越冬病原菌。
二是药剂防治。
①6月初至7月下旬，用25%丙环唑乳油1000-1500倍液、15%三唑酮可湿性粉剂800-1200倍液、12.5%烯唑醇可湿性粉剂600-800倍液、50%退菌特可湿性粉剂600-800倍液，或20%粉锈宁乳剂1500-2000倍液，每隔15-20天喷施一次，连喷2-3次。
②花椒树于秋季果实采收后，或翌年春季椒芽萌发前喷洒1次1∶2∶600倍的波尔多液（硫酸铜500克，石灰1000克，水300千克），能杀死树体上寄生的病菌并防止病菌晚秋、早春入侵，预防病菌的侵染和蔓延。③及时落叶杂草，集中烧毁，减少菌源。
花椒锈病是花椒叶部重要病害之一。严重时花椒提早落叶，直接影响次年的挂果。发病初期，在叶子正面出现2-3mm水渍状褪绿斑，并在与病斑相对的叶背面出现黄橘色的锈状物。
花椒锈病为普发性病害，又称花椒鞘锈病、花椒粉锈病。流行年份发病率可达50%-100%，可造成椒叶在采椒后不久便大量脱落，使椒树再次萌发新叶。发病初期，在叶片正面出现直径为2-3毫米的水浸状褪绿斑，与病斑相对应的叶背面出现圆形黄褐色的疱状物———夏孢子堆。在较大的夏孢子堆周围往往出现许多小的夏孢子堆，排列成环状或散生。这些疱状物破裂后释放出橘黄色粉状夏孢子。发病后期在叶片正面，褪绿斑发展成为3-6毫米深褐色坏死斑。叶背夏孢子堆基部产生褐色或橘红色蜡质冬孢子堆，突起不破裂，呈圆形或长圆形，排列成环状或散生。发病严重时，叶柄上也出现夏孢子堆及冬孢子堆。该病由花椒鞘锈菌侵染所致，病原属担子菌亚门，锈菌目，栅锈菌科，鞘锈菌属。普发于甘肃、陕西、山东、山西、河北、河南、四川等花椒栽培区。
此病一般于6月中下旬开始发生，7-9月上旬为发病盛期。在降雨多，特别是秋季雨量大，降雨频繁的情况下，病害容易流行。病害多从树冠下部叶片发生，并由下向上蔓延，花椒果实成熟前病叶大量脱落，至10月上旬病叶已全部落光，新叶陆续生长。此病的发生与椒园所处地势环境有关，阳坡较阴坡发病轻，大红袍发病重，其次是豆椒，狗椒较抗病。此外，若在椒树行间种植高秆作物，因通风透光不良，可加重发病。
防治该病，一是人工防治。①栽培抗病品种。可用狗椒等抗病品种与大红袍等染病品种混合栽种。还可通过无性繁殖或嫁接等方法培养抗病品种。②加强肥水管理，增强树势，提高椒树自身的抗病能力。③清园。花椒落叶之后，将病枝落叶进行清扫，集中烧毁，和消灭越冬病原菌。二是药剂防治。①6月初至7月下旬，用25%丙环唑乳油1000-1500倍液、15%三唑酮可湿性粉剂800-1200倍液、12.5%烯唑醇可湿性粉剂600-800倍液、50%退菌特可湿性粉剂600-800倍液，或20%粉锈宁乳剂1500-2000倍液，每隔15-20天喷施一次，连喷2-3次。②花椒树于秋季果实采收后，或翌年春季椒芽萌发前喷洒1次1∶2∶600倍的波尔多液（硫酸铜500克，石灰1000克，水300千克），能杀死树体上寄生的病菌并防止病菌晚秋、早春入侵，预防病菌的侵染和蔓延。③及时落叶杂草，集中烧毁，减少菌源。