木耳，别名黑木耳、木菌、光木耳。在黑木耳栽培的实践过程中，导致黑木耳减产或绝收的三大病害有“红眼病”“绿藻病”“流耳”。这三大病害发生期都在开口期至中耳期、成耳期发生。这几种病害大都是栽培者技术不到位管理不规范所致。目前对于几种病害防重于治。还没有能根治的良药。
红眼病，症状：开口或打眼后5—10天左右，发现开口打眼处有红褐色的粘液，自口溢出，有绿霉同时出现，大面积滋生。发病原因：①培养室内培养架设计不合理，间隔层太小，摆袋拥挤或上摞或通风有死角。袋与袋之间产生热量得不到散发，致使菌袋内外出现温差过大，袋内集聚大量的蒸汽水，使菌丝不透气而死亡。还可能出现袋内顶部菌丝因高温死亡出现袋口吐红水。②有的打口后的菌袋归堆，堆积过紧。还有的堆回培养室。因为菌袋打眼后，透气好，菌丝发育旺盛，菌丝体要释放出大量的热量，稍不注意就容易造成高温烧菌，菌丝体死亡，细胞组织破裂，营养泌出成为红水。
绿藻病，症状：菌袋内表层有绿色的像青苔状，严重时木耳子实体都生长。吸收菌袋营养，造成袋内积水严重导致烂袋现象发生。发病原因：①水源有污染，死水泡、鱼塘、水源有藻类滋生。②装袋过松，开口在褶皱处，浇水时长时间有积水，通过阳光直射产生绿藻。③浇水过重，导致袋内积水。绿藻病发生后，因为有袋皮包裹几乎无药可治。
流耳，症状：黑木耳中耳期、成耳期腐烂脱落。发病原因：①菌种老化，选择优良抗逆性强的菌种。②培养料配比不当，麦麸、米糠等辅料添加过多，营养过盛，菌丝体老化快，子实体没长成，菌丝体开始老化收缩，造成流耳。③高温多雨浇水过重，袋内含水量偏高，因袋内菌丝体长成后，在酶的分解过程中营养物质的转化，菌丝体的含水量不断增高，袋内菌丝没有充分干燥，导致菌丝透气不良，遇到高温时很容易使菌丝因缺氧而窒息死亡，出现烂耳。④ 通风不良、水源不清洁。地势过洼，排水不畅。袋与袋之间过密，通风不良。水源污染造成子实体感染病变。⑤采收不及时，当耳片八分熟及时采收晾晒。
在黑木耳栽培过程中一定要做到合理管控，真所谓三分种七分管。一定要了解干长菌丝，湿长耳。干干湿湿，干湿交替。看天浇水，看耳定量的含义。做到以防为主，来提高黑木耳产量与质量。
一、黑木耳绿霉病
症状：菌袋、菌种瓶、周围及子实体受绿霉感染后，初期在培养料或子实体上长白色纤细的菌丝，几天后，便可形成分子孢子，一旦分生孢子大量形成或成熟后，菌落变为绿色、粉状。
防治：保持耳场周围环境的清洁卫生；耳场必须通风良好、排水便利；出耳后每3d喷1次1%石灰水，有良好的防霉作用，若绿霉菌发生在培养料表面且尚未深入料内时，用pH10的石灰水擦洗，可控制绿霉病菌的生长。
二、烂耳（又名流耳）
症状：耳片成熟后，耳片变软，耳片甚至耳根自溶腐烂。
防治：针对烂耳的原因加强栽培管理，注意通风换气、光照等；及时采收，耳片接近成熟或已经成熟立即采收。
三、耳菌块防霉菌
木耳菌块防霉菌污染时导致木耳菌块减产、影响产品质量的一个重要原因。产生原因为：栽培管理措施不当；培养基不；菌种质量不纯，或木屑菌种多次代传，降低菌种生活力；塑料袋韧性差，在操作管理中被刺破；环境条件差。这些均能导致霉菌发生。青霉、木霉是木耳菌块上常见的杂菌。
防治措施：选用抗霉能力较强的菌株；选用新鲜原材料越夏；保护环境清洁，出菇期间，在采收批耳后，，每3-5d在地面喷1次1%石灰水，或1%-2%煤皂溶液，或0.1%多菌灵，或交叉使用，以控制杂菌生长。加强水分管理，要根据菌块水分散失情况和空气流量情况喷水。
一、常见杂菌：
1.环纹炭团菌：是危害壳斗科耳木的主要杂菌。多出现在耳木表面的纵沟中，形似黄豆大小的黑色颗粒，严重时连成片。此菌多在潮湿阴蔽处发生。耳木被害后，抑制黑木耳菌丝生长，甚至其他杂菌也不能生长。
2.牛皮箍：此菌有黑白两种，紧贴在耳木上生长，形似贴药膏。多在阴雨天发生，引起木质部粉状腐朽，这种耳木便不发生耳芽。
3.韧皮菌、朱红栓菌、绒毛栓菌：这些菌都能引起耳木腐朽、影响木耳的生长。
4.青霉、木霉：这些菌能在耳木上生长、消耗养分。在代料栽培木耳是一种主要杂菌，影响木耳生长。
二、常见害虫：危害木耳的主要害虫有伪步行虫、线虫、蚂蚁、蓟马等，这些害虫或咬食耳片，或咬食菌丝，或蛀食耳木，造成危害。此外，还有蛞蝓、尺蠖、小蜘蛛、天牛、吉丁虫等危害耳木的害虫。
三、防治方法：
1.选用高产抗逆力强菌种。
2.尽量保护好段木树皮，用石灰水对截口消毒。
3.保持耳场清洁、经常消毒。
4.木耳成熟后要及时采收，并做好收耳后清理工作。
5.发现感染杂菌或虫害的耳木或培养料，要立即搬离现场，减少病原传播。
6.局部发生病虫害，可采用人工捕捉，部分挖除等方法处理。
7.做好越冬耳木管理。
8.栽培过程中做好温度、水分、通气的调控，采取促进木耳生势为主，防治为副的管理方针。
一、黑木耳绿霉病
症状：菌袋、菌种瓶、周围及子实体受绿霉感染后，初期在培养料或子实体上长白色纤细的菌丝，几天后，便可形成分子孢子，一旦分生孢子大量形成或成熟后，菌落变为绿色、粉状。
防治：保持耳场周围环境的清洁卫生；耳场必须通风良好、排水便利；出耳后每3d喷1次1%石灰水，有良好的防霉作用，若绿霉菌发生在培养料表面且尚未深入料内时，用pH10的石灰水擦洗，可控制绿霉病菌的生长。
二、烂耳（又名流耳）
症状：耳片成熟后，耳片变软，耳片甚至耳根自溶腐烂。
防治：针对烂耳的原因加强栽培管理，注意通风换气、光照等；及时采收，耳片接近成熟或已经成熟立即采收。
三、耳菌块防霉菌
木耳菌块防霉菌污染时导致木耳菌块减产、影响产品质量的一个重要原因。产生原因为：栽培管理措施不当；培养基不；菌种质量不纯，或木屑菌种多次代传，降低菌种生活力；塑料袋韧性差，在操作管理中被刺破；环境条件差。这些均能导致霉菌发生。青霉、木霉是木耳菌块上常见的杂菌。
防治措施：选用抗霉能力较强的菌株；选用新鲜原材料越夏；保护环境清洁，出菇期间，在采收批耳后，每3-5d在地面喷1次1%石灰水，或1%-2%煤皂溶液，或0.1%多菌灵，或交叉使用，以控制杂菌生长。加强水分管理，要根据菌块水分散失情况和空气流量情况喷水。
一、常见杂菌：
1.环纹炭团菌：是危害壳斗科耳木的主要杂菌。多出现在耳木表面的纵沟中，形似黄豆大小的黑色颗粒，严重时连成片。此菌多在潮湿阴蔽处发生。耳木被害后，抑制黑木耳菌丝生长，甚至其他杂菌也不能生长。
2.牛皮箍：此菌有黑白两种，紧贴在耳木上生长，形似贴药膏。多在阴雨天发生，引起木质部粉状腐朽，这种耳木便不发生耳芽。
3.韧皮菌、朱红栓菌、绒毛栓菌：这些菌都能引起耳木腐朽、影响木耳的生长。
4.青霉、木霉：这些菌能在耳木上生长、消耗养分。在代料栽培木耳是一种主要杂菌，影响木耳生长。
二、常见害虫：危害木耳的主要害虫有伪步行虫、线虫、蚂蚁、蓟马等，这些害虫或咬食耳片，或咬食菌丝，或蛀食耳木，造成危害。此外，还有蛞蝓、尺蠖、小蜘蛛、天牛、吉丁虫等危害耳木的害虫。
三、防治方法：
1.选用高产抗逆力强菌种。
2.尽量保护好段木树皮，用石灰水对截口消毒。
3.保持耳场清洁、经常消毒。
4.木耳成熟后要及时采收，并做好收耳后清理工作。
5.发现感染杂菌或虫害的耳木或培养料，要立即搬离现场，减少病原传播。
6.局部发生病虫害，可采用人工捕捉，部分挖除等方法处理。
7.做好越冬耳木管理。
8.栽培过程中做好温度、水分、通气的调控，采取促进木耳生势为主，防治为副的管理方针。