种子发芽率是种子品质和实用价值的主要依据，那么，我们如果去鉴定种子的发芽率呢？
1.浸种催芽法。先将100粒种子用水浸约两小时吸胀，放于湿润草纸上，盖以湿润草纸，置于氧气充足，室温10―20℃环境中，让种子充分发芽；再以发芽的种子粒数除以100，乘以100%，求得发芽率。这种测定方法虽然准确，但需要8天时间。
2.红墨水染色法。以一份市售红墨水加19份自来水配成染色剂;随机抽取100粒玉米种子，用水浸泡两小时，让其吸胀;用镊子把吸胀的种胚、乳胚一一剥出;将处理后种子均匀置于培养器内，注入染色剂，以淹没种子为度，染色15――20分钟后，倾出染色剂，用自来水反复冲洗种子。死种胚、胚乳呈现深红色，活种胚不被染色或略带浅红色，据此判断活种子数，以此除以100，乘以100%，则为发芽率。
3.外观目测法。用肉眼观察玉米种胚形状和色泽。凡种胚凸出或皱缩、显黑暗无光泽的，则种子新鲜，生活力强，可作生产用种。
我们可以根据不同种类的种子控制相应的温度、水分、光照等条件，再到规定的时间鉴定正常幼苗的数量，计算出种子的发芽率。
随机抽取一定数量的种子放在培养皿中，给于发芽所环境，在一定日期后，捡数发芽的种子数，除以种子总数便得
取5毫升红墨水，用95毫升的冷开水或自来水稀释，就配制成了5%的染色液。配制多少染色液要看种子多少来决定，配好随即使用。取50粒玉米种子，浸泡在30摄氏度左右的温水里，大约泡三四个小时。种子充分膨胀以后，用刀片把每粒种子纵切成两半。再把它们全部浸没在盛有红墨水染色液的碗里，半小时以后，把红墨水染色液倒掉，再用自来水反复冲洗种子，一直到冲洗后的水不带红色为止。把洗净的种子平铺在白纸上，仔细地察看每一粒种子的胚和胚乳的着色情况。
如果种子的胚，特别是胚根部分，已经全部被染成红色，而且和胚乳的着色程度相近，这样的种子肯定是丧失发芽能力的死种子。如果种子的胚出现斑斑点点的红色，说明种子的部分组织已经死亡，是生命力较弱的种子。如果种子的胚和胚乳完全没有着色，或者略带浅红色，这些种子就是生命力较强的活种子。用这种方法就可以快速地测算出种子的发芽率。为什么用红墨水染色就能知道种子的死活呢这是由于种子活细胞的原生质膜是一种半透膜，这种半透膜不能透过红墨水的微小颗粒，所以活种子的胚就不会染色。死种子细胞的原生质膜丧失了半透性，红墨水的颗粒就可以自由地进入细胞，胚和其他部位就很容易染上红色。
直接法：在培养皿或碟子上铺几层经蒸煮消毒的吸水纸或卫生纸，预先浸湿，将种子放在上面，然后加清水淹没种子，浸4-6小时，使其充分吸水，再把淹没的水倒出，把种子摆匀盖好，以后随时加水保持湿润。也可将经消毒的纱布浸湿，把种子摆在上面，卷成卷，放在温度适宜的地方，随时喷水保持湿润，逐日检查记载发芽粒数。
间接法：来不及用直接法测定发芽率时，也可采用间接法，即染色法。先把种子浸于清水中2小时，捞出后取200粒分等量两份测定。用刀片从小麦腹沟处通过胚部切成两半，取其一半浸入红墨水10倍稀释液中1分钟，捞出用清水洗涤，立即观察胚部着色情况。中胚未染色的是有生活力的种子，完全染色的为无生活力的种子，部分斑点着色的是生活力弱的种子。这种测定结果与直接做发芽试验的结果基本一致，但因部分斑点着色的种子也在计算内，此法测定的发芽率略显偏高，因为一些发芽率弱的种子实际不能发芽。