水稻旱育秧苗秧苗虽不易烂秧，但易发生立枯病，重者死苗50%以上，采取以下措施，可以有效地防治立枯病。
1、苗床土壤调酸消毒。苗床用营养土，按说明应用。
2、播种不要过密，以免产生弱苗；掌握播种量，是培育秧苗壮苗的关键一环。每平方米播种量为3两为宜，不能超过半斤，如播种过密，秧苗瘦化，抗性减弱，易感立枯病，而壮苗抗性较强，不易感染立枯病。
3、药剂防治：1叶1心至2叶1心期，易发生立枯病侵染死苗，可用黄秧青每袋25克加水3-5公斤喷施66平方米，或用42%立枯一次净可湿性粉剂40兑水100—120公斤浇在苗床上，也可以用35%枯必净或42%立枯一次净在发病初期每袋40克兑水100公斤进行叶面喷雾，隔5—7天再喷1次，连喷2次，
4、克服低温，以免诱发立枯病。播种至出苗以保温为主；1叶1心时以控湿为主，膜内温度保持在25℃；2叶1心时，晴天上午10时至下午4时半开膜，阴天中午开膜1—2小时，雨天打开膜换气，但膜内温度不能低于12℃，否则易诱发立枯病。
水稻立枯病是水稻旱育秧主要的病害之一，其发病的主要原因是气温过低、温差过大、土壤偏碱、光照不足秧苗细弱、种量过大等因素，田间症状主要表现为出苗后秧苗枯萎，容易拔断，茎基部腐烂，有烂梨味，发病较重的整片死亡，病株基部多长有赤色霉状物。秧苗在2～3叶期时胚乳将近耗尽，抗寒力差，日平均气温低于12～15~C则生育受阻，抗病性显著削弱，病菌易侵入，此时若遇低温阴雨易发生立枯病。所以，旱育秧苗2～3叶期是立枯病流行的主要时期。
危害症状：
芽腐：出苗前或刚出土时发生，幼苗的幼芽或幼根变褐色，病芽扭曲、腐烂而死。在种子或芽基部生有霉层。
针腐：多发生于幼苗立针期到2叶期，病苗心叶枯黄，叶片不展开，基部变褐，有时叶鞘上生有褐斑，病根也逐渐变为黄褐色。种子与幼苗基部交界处生有霉层，茎基软弱，易折断，育苗床中幼苗常成簇，成片发生与死亡。
黄枯、青枯：多发生于幼苗2.5叶期前后，病苗叶尖不吐水，叶色枯黄、萎蔫，成穴状迅速向外扩展，秧苗基部与根部极
水稻立枯病烂秧易拉断，叶片打绺。在天气骤晴时，幼苗迅速表现青枯，心叶及上部叶片“打绺”。幼苗叶色青绿，整株萎蔫。在插秧后本田出现成片青绿枯死。
防治立枯病要以防为主，防治结合：
1、在水稻秧苗1-2叶期时：使用青枯立克 50ml+ 大蒜油 15ml，兑水15公斤喷雾，5—7天1次，连喷2次。为增强植株抗病能力，建议喷雾时每15公斤水加叶面肥。发病中后期：使用克青枯立克100ml+大蒜油15ml，进行喷雾，3天一次，连喷2到3次。
2、精心选种与晒种。提高催芽技术，防止种子受伤，提高种子生命力和抗病力。
3、适期播种，播种密度不要过大。应在气温稳定通过6℃ 时播种，不要盲目抢早。从理论上讲，播种密度以300 g/m2为宜。然而在实际生产中，农民为了节省农膜等生产成本，以及考虑到出苗率、使用插秧机等原因，往往会加大播量，即便如此，播种量也不能超过500 g/m 。
4、苗床管理。要做好防寒、保温、通风、练苗等环节的工作，提高幼苗抗病力，防止和减轻立枯病、恶苗病的发生。
5、加强田间管理。要做好防寒、保温、通风、炼苗环节，做到前保（出苗前保温）、中控（出苗后至3叶期控温）、后炼（3叶期至插秧前调温），提倡稀插早育苗，控制温湿度不徒长。一叶一心期保持温度25～30~C尽量少浇水，第2叶期后必须使其逐渐适应寒冷条件，三叶一心期温度不超过25℃，土壤水分充足，但不能过湿。3叶期后白天应揭膜通风锻炼，夜间如果无霜冻也要揭膜使之经受低温，这样可以培育出抗寒力强的壮秧。
6、苗床土壤消毒。用3.2 恶甲水剂300倍液喷洒，用广灭灵水剂浸种24，-48 h或于1叶1心期喷洒500～1000倍液。水稻秧苗1叶1心期，每盘用15%立枯灵液剂0.9 g加水1 L喷洒。用70%敌克松粉剂500倍液或1%硫酸铵进行喷雾，并注意保持床土湿度，以有效防止立枯病的危害。在秧苗发病初期，施立枯清每平方米用药l～1.5 g，对水均匀喷在苗床上。