棉花炭疽病防治可从多方面着手，选择无病种子，从基本做起，使棉花抗病性增强，一旦发病，可用化学药剂防治。
棉花炭疽病防治方法：
（1）选用无病种子和种子消毒是防治该病的关键。
（2）播种前种子处理。
（3）发病初期喷洒50%醚菌酯（翠贝）干悬浮剂3000倍液或40%炭疽福美可湿性粉剂600-800倍液、25%咪酰胺（使百克）乳油1000倍液、20%氟硅唑咪鲜胺800倍液、50%甲羟鎓（星）可湿性粉剂1600倍液、25%嘧菌酯（阿米西达）悬浮剂1500倍液。38%噁霜灵嘧菌酯800倍液，56%嘧菌酯百菌清800倍液。