果园深翻改善土质要分清主次来进行，由于果园密闭不利于机械作业，果园务工人员老龄化，冲施肥等肥料的冲施和撒施，导致果园土壤耕作深度降低，耕作层逐渐浅化，犁底层厚度增加，土壤酸化板结，既妨碍土壤水分的入渗，使土壤蓄水、保水和供水的能力变差，又不利于根系生长，大多数果树的根系都上返了，果树的树势受到严重影响。因此果园深翻改土显得尤为重要。
据试验，每株果树有1/4左右的土壤良好就能这株果树的正常生长。因此，建议结合秋施基肥每年深翻1/4左右的树盘，4～5年可完成果园土壤的全面深翻，以果树连续生长的能力。果园深翻改土应避免在干旱和雨水多的时候进行，否则对果树根系的恢复和生长不利。