除气象条件影响作物的生长，从而影响作物对磷素的吸收外，磷肥增产效用的大小主要与土壤的性质有很大的关系。在南方酸性土壤中施磷肥可选用磷矿粉。
因为酸性土壤对水溶性磷肥（如过磷酸钙）有固定作用，这主要是土壤中铁离子、铝离子能和磷酸根离子结合生成磷酸铁、铝，降低了磷素的肥效。磷矿粉则在酸性条件下可逐步释放养分而不致发生固定作用。
在华北石灰性土壤上，施用磷矿粉则不能发挥肥效。因为石灰性土壤pH值中性偏碱，不能使磷矿粉中的磷酸溶解释放，故应选择施用过磷酸钙、重过磷酸钙等水溶性的磷肥品种。
试验表明，在土壤各种pH值条件下，都不同程度地存在着磷素的固定问题，磷素的有效性是非常有限的，只有在靠近中性的微酸性至微碱性的范围内，特别是在土壤有机质含量高的情况下，磷素的有效性较高。
为了提高土壤中磷素的有效性，要施用磷肥，以增加水溶性磷的含量。此外，不能忽视改变土壤中的固磷条件，如在酸性土壤上施用石灰，以减少活性铁、铝；与有机肥混施，使铁、铝、铜都被络合，减少磷素的固定。
在碱性和石灰性土壤上，大量有机肥与磷肥结合施用，就可以大大提高磷肥的有效性。
在施用水溶性磷的方法上，采用集中施用的原则，以减少它与土壤接触的机会，从而避免固定。对于磷矿粉则刚好相反，设法提高它与土壤接触的机会，提高有效性。