种植黄芩应选择阳光充足，排水良好，土层深厚、肥沃的砂质壤土为宜。每亩施基肥复合肥30---60公斤，耕深25-30厘米。耙细整平，作宽1.2米的畦，长短不限：
黄芩采用种子或分根方式繁殖黄芩：
1.黄芩种子繁殖法：
播种前将种子用温水浸泡5-6小时，捞出稍晾即可播种。播种时间：分春播和秋播，春播和秋播，春播在4月中旬至5月上旬，秋播在8月中旬至9月下旬，按行距30-40厘米开沟，沟深0.5-1厘米，将种子均匀播入沟内，覆细土，稍镇压后浇水，保持土壤湿润，在15-18℃的温度下，播后15天左右出苗。黄芩种子发芽率60%。亩播种量2千克。
2.黄芩分根繁殖法：
春季黄芩未萌发新芽之前，将根挖出，切下主根供药用，然后根据根茎块的大小，将母株根茎切成若干块，每块有2-3个芽，按行株距30厘米15厘米挖穴栽种，覆土压实，浇水，10天左右可长出幼苗。此法可缩短生长周期，但比直播的根杈多。