黄精常见的病害有黑斑病、叶斑病及炭疽病，虫害主要有蛴螬和地老虎。具体危害及防治方法如下：
1、黄精黑斑病
黄精主要病害，病原为真菌中的一种半知菌，危害叶片，发病初期，叶片从叶尖出现不规则黄褐色斑，病健部交界处有紫红色边缘;以后病斑向下蔓延，雨季则更严重。病部叶片枯黄。
防治方法：收获时清园，消灭病残体;发病前及发病初期喷1∶1∶100倍波尔多液或50%退菌特1000倍液，每7-10天1次，连续数次。
2、黄精叶斑病：
主要危害叶片，发病初期由基部开始，叶面出现褪色斑点，后病斑扩大呈椭圆形或不规则形，大小1cm2左右，中间淡白色，边缘褐色，靠健康组织处有明显黄晕，病斑形似眼状。病情严重时，多个病斑愈合引起叶枯死，并可逐渐向上蔓延全株叶片枯死脱落。该病病原属半知菌亚门。
发病特点：该病一般于6月初在冬季未死亡的植株叶上出现新病斑，然后于7月初转移到当年萌发出的新植株基部叶上始发，并逐渐上移，到7月底发病已较严重，出现整株枯死现象。8、9月伴随着多种其他原因导致的田间植株死亡，发病达到顶峰。10月，发病植株上又有零星病斑出现，11月上旬普遍发生且严重。
防治方法：同黑斑病。
3、黄精炭疽病：
主要危害叶片，果实亦可感染。感病后叶尖、叶缘先出现病斑。初为红褐色小斑点，后扩展成椭圆形或半圆形，黑褐色，病斑中部稍微下陷，常穿孔脱落，边缘略隆起红褐色，外围有黄色晕圈，潮湿条件下病斑上散生小黑点。病原为半知菌亚门，腔孢纲，黑盘孢目，刺盘孢属真菌。
发生特点：4月下旬始发，8-9月为严重。有逐年加重的趋势。
防治方法：多菌灵或同黑斑病防治方法。
4、蛴螬：
属鞘翅目金龟甲科。以幼虫危害，咬断幼苗或咀食苗根，造成断苗或根部空洞，危害严重。用药同地老虎或以农药用常规低毒农药杀之。
5、地老虎：
危害幼苗及根状茎。防治方法：可用75%辛硫磷乳油，按种子量0.1%拌种;田间发生期，用90%敌百虫1000倍液浇灌;用黑光灯或毒饵诱杀成虫;施用粪肥要充分腐熟，用高温堆肥。