土壤缺镁是甜瓜缺镁的主要原因。土壤缺镁一是与土壤质地有关。二是与土壤的酸碱性有关。温度过低也会引起缺镁，当地温低于15℃以下时，甜瓜的根系成长受阻，此刻虽然土壤中不缺镁，但由于甜瓜的根系成长发育欠好，也会按捺根系对镁的吸收。此外，当甜瓜过量施用钾肥和铵态氮肥时，会按捺甜瓜对镁离子的吸收，然后诱发植株缺镁。
防治方法有以下三种：
1.补施镁肥
对土壤供镁不足的田块，可在甜瓜麦苗移栽定植前，随基肥每亩补施硫酸镁2-4公斤，或在基肥中增施钙镁磷肥。磷肥与镁肥合作施用有助于对镁的吸收。
2.操控氮、钾肥用量
对镁元素含量较低的土壤，要避免过量施入氮肥和钾肥。在甜瓜成长期间，对氮、钾肥采用少量多次的施用办法。
3.进步温室温度
通过晚揭帘和早放帘等办法进步温室温度，特别是在甜瓜坐瓜及膨大期后，一定要坚持地温在15℃以上。以进步对镁元素的吸收能力。
4.叶面喷肥
对当下现已呈现甜瓜缺镁症状的温室，可叶面喷施0.5-1%的硫酸镁水溶液，每5-7天1次，接连3-4次即可。