甜菜收获后贮藏的方式不多，需要分清是否过冬贮藏，因为临时贮藏与过冬贮藏的方法不一样，这样就不会发生同时贮藏的蔬菜安然无恙而甜菜坏掉。
甜菜临时贮藏的方法
甜菜临时贮藏是指种根收获后到入冬窖藏前，这一段时间在田间或窖外的假贮。种根收获后，新陈代谢旺盛，气温较高，窖温也较高，如果种根收获后立即入窖，会使窖温更高，导致种根发芽，甚至腐烂变质。在田间或窖外假贮一段时间（一个月左右），可以逐步降低种根的呼吸强度，使受冻或萎蔫种根显现出来。这样，入冬窖藏时，种根已处于休眠状态，受冻和萎蔫种根也可被淘汰掉，从而可以窖藏质量。
临时贮藏的方法：先挖一条深30—50厘米、宽100厘米左右的沟，沟的长度视种根数量多少而定，将种根堆贮沟内，堆高100厘米左右，呈半圆形，然后在种根上覆土15—20厘米。
甜菜越冬贮藏的方法
这种保存方法有一个比较俗套的叫法：闷窖。这是保存像甜菜这种主要以根部为食材的蔬菜的常见保存方法。在正式闷窖的前半个月就要开始着手准备地窖。地窖的规格是有讲究的，根据经验，闷窖的尺寸大概是长5米、宽大概是成年人一步的长度，深要没过成人的头顶，但多不过两米。为了节省用地，每个地窖之间要预留半米左右的土。
提前半个月准备地窖是为了有足够的时间把里面晒干免得使保存的东西腐烂。临放进去之前还要简单的消一下毒，尽量选择在天气晴好的天气把甜菜放进去。
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目前，除部分有条件的地区和农场采用机械收获、机械挖掘外，一般都采用畜力收获和人工挖掘。新疆和黑龙江产区已引进了国外进口自走式甜菜收获机。每次收4行或6行不等。分两段式收获（切叶和块根收获分开进行）和联合收获，工作效率高，适合于大面积机械化作业。大部分采用机械牵引或畜力牵引的小型挖松机、铲趟犁、翻地犁将甜菜挖松或从垄上趟出，用人工集堆，然后进行人工切削。
1种根收获
1.1收获时期根据我省的气候条件，9月中下旬即可出现早霜、10月上旬有严重霜冻，结合多年来的实践证明种根的收获时期宜在9月末收完为佳。
1.2收获方法采用甜菜起掘机起收种根。起掘机有两种：一种是铲式起掘机，入土深度25～30cm，切断种根根尾，甜菜仍直立原处，需人工拣堆。另一种是犁式起掘机，可将甜菜起出土面自动集堆，后一种起掘机需修削多少起掘多少，起掘后的甜菜不能过夜以免受冻、失水。此外在无起掘机的情况下，也可以用五铧犁或川式大犁起收。种根起收时，一定要做到“四随”即随起、随捡堆、随修削、随假贮。必须做到当日起收，当日假贮完毕，种根不受冻害和失水萎蔫。
1.3种根质量种根质量好坏，从以下四个方面衡量，一是根重，原种种根400g以上，生产用种种根100～500g。二是根头要求当年无抽薹，根头小，不多头，不空心。三是根体根形正常，根体直，无大的分叉根，无病虫危害。四是外观根色正常，不萎蔫失水，无冻害和较重的机械损伤。
1.4种根修削方法按照种根质量标准入选的甜菜，需要进行认真修削成种根。先轻轻去掉根上的泥土用刀背（切勿伤表皮），摘净根头枯死的叶柄。然后用刀自下向上削去叶柄，以不伤根皮和顶芽为准，保留叶柄长3～5mm，削好的种根，其根头应是铅笔尖形，叶柄基部呈鱼鳞状。注意不要削掉根头顶芽，因为没有顶芽不能作种根。也不要将叶柄留得过长，叶柄过长窖藏时易于腐烂。
2种根贮藏技术
在我省种根贮藏期达200～220天。在这7个多月的时间里，必须创造适宜的环境条件，种根不冻不热，处于良好的休眠状态，以减少根体营养消耗和顺利通过春化阶段，为翌年采种打好基础。窖藏期间的适宜温度是0～2℃，适宜湿度为85%～95%，如果窖温过高，轻则种根发芽过长，消耗养分过多，重则腐烂变质，造成损失严重。窖温过低，则种根受冻，也会腐烂变质，失去种根价值。
窖藏损失的大小，取决于两个条件：一是种根质量，即种根是否萎蔫失水或受冻。萎蔫失水或受冻的种根，组织遭受破坏，贮藏中易于腐烂。二是窖的温湿度，只要严格控制好温湿度，就可大大降低损失。
3贮藏方式
3.1临时贮藏临时贮藏，是指种根收获后到入冬窖藏前[库巴尔www.ku82.com]，这一段时间的田间或窖外假贮。因为种根收获后，新陈代谢旺盛，气温较高，窖温也较高。如果种根收获后立即入窖，会使窖温更高，致使种根发芽，甚至腐烂变质。在田间或窖外假贮一段时间（1个月左右），可以逐步降低种根的呼吸强度，使受冻或萎蔫种根显现出来。这样，入冬窖藏时，种根已处于休眠状态，受冻和萎蔫种根也可被淘汰掉，从而可以窖藏质量。
临时贮藏的方法，先挖一条深30～50cm，宽100cm左右的沟，沟的长度视种根数量多少而定，将种根堆贮沟内，堆高100cm左右，呈半圆形，然后在种根上覆土15～20cm。
3.2越冬贮藏大地封冻前，田间临时贮藏的种根，需要运入种根窖内进行越冬贮藏。越冬贮藏有两种方式：一是原种种根贮藏，一般采用式种根窖贮。二是生产用种种根贮藏，一般采用简易式种根窖贮。
简易式种根窖俗称闷窖，是一种地下式土窖，在我省一般采用深2m，宽1m，长5m的闷窖，每亩种根贮藏窖需要延长2m左右。为了节省窖藏用地，窖的长度可以随需要延长，但每隔5m需留30～50cm厚的土格隔开，此种窖称为串联式闷窖。也可以采用并列式，窖与窖之间应相隔3～5m宽。在地下水位较高的地区，可以选择地势倾斜的地段挖窖，窖的规格同前，但需要在窖底中间顺坡向挖宽30cm，深30cm的顺水沟，并在地势低的一端挖1个掏水坑，以便将积水掏出。我省甜菜种根入窖时间在10月15～25日。入窖前先将窖内打扫干净，窖底撒施少量硝石灰粉消毒。易选择晴朗天气入窖。入窖时先打开临时贮藏堆，严格淘汰受冻和萎蔫种根，窖内甜菜种根堆高1.3～1.5m，上面摆平，覆以砾状干土5～10cm。然后在窖顶铺上高粱秆或玉米秆，两端各留出一大一小的空隙作出入口和通气孔，覆土封窖。覆土前将通气口做成凹状的洞，用草捆堵好，可以随时打开。覆土时先将高梁秆的两端压土踩实，再向中间覆土。覆土可分2次进行，第1次覆土30cm左右，第2次覆土高至0.8～1.0m。
闷窖管理一般每10～20个窖设一个观测窖，每日测定窖内空间温度和种根堆内温度。
入窖初期，严防堆温上升过高（4℃以上），避免发芽和腐烂。其方法是利用通风口调节窖温，20天左右若窖温降至1～2℃，说明窖内正常，可以堵死通风口。若堆温仍在4℃以上，说明窖内种根可能有腐烂现象发生，应该开窖检查。通风口堵死后的空间温度允许变化幅度为0～3℃，堆温允许变化幅度为-1～2℃。