无公害菜椒巧选农药来防病虫害：
药剂拌种。每1千克种子用绿亨1号1-1.5克与50%福美双可湿性粉剂3-4克或绿亨3号8-10克拌种，拌后随后播种。
药剂浸种。用10%磷酸三钠液浸种30分钟或100倍福尔马林浸种30分钟或50%多菌灵500倍液浸种2小时。
播种至定植期
1.选用75%甲基硫菌灵600-800倍液或75%百菌清1000倍液防治立枯病；72.2%普力克水剂5-7.5毫升／平方米喷苗床防治猝倒病，兼治早疫病、炭疽病等。
2.在苗床期每667平方米用仵氏辣椒粉两袋或克病灵500-800倍液、或病毒a可湿性粉剂400倍液喷雾，防治病毒病。每隔7天喷一遍，连喷3次。均能收到良好效果。
定植至结果期
用50%避蚜雾或10%吡虫啉5克／（亩）对水40千克防治蚜虫，兼治棉铃虫；交替使用dt乳剂400毫升／（亩），或用20亿pib/毫升棉铃虫核型多角体病毒悬浮剂50～60毫升／（亩）防治棉铃虫，兼治烟青虫，蚜虫。在枯萎病发病前和发病初期用绿亨1号3000倍液灌根，或绿亨2号600 倍液或绿亨8号1500～2000倍液，或青椒安2号500倍液喷雾或灌根，每隔7～10天用1次，连续2～3次，兼治其它病害。对病毒病可用植病灵 1000～1500倍液，或用病毒a600倍液，或用2%中南霉素300～400毫升／（亩）喷雾，效果显著。
结果期
1.病害的防治。在发病初期田间喷药，用75％甲基硫菌灵600-800倍液、或40%多菌灵400～600倍液、或炭疽福美600倍液，防治炭疽病、白粉病、疫病等；用72%农用链霉素20克／（亩）、或25%青枯灵可湿性粉剂，防治细菌性疮痂病：用72%普力克水剂、或30%恶毒灵水剂 800倍液、或70%代森锰锌可湿性粉剂500倍液，防治枯萎病、灰霉病；用20%病毒a或1.5%植病灵可湿性粉剂500倍液防治病毒病；用72%克露可湿性粉剂600～800倍液、或77%可杀得可湿性粉剂500倍液防治晚疫病、绵疫病、绵腐病等；保护地可用5%霜克粉尘剂、或5%霜霉威粉尘剂、或 5%百菌清粉尘剂1千克／（亩）喷粉防治多种病害。
2.虫害的防治：①幼虫低龄阶段喷雾：用0.9%阿维菌素3000倍喷雾防治茶黄螨；用10%大功臣可湿性粉剂1000倍防治蚜虫：用2.5% 功夫乳油，或10%吡虫啉乳油，或4.5%高效氯氰菊酯乳油1500倍防治蚜虫、棉铃虫、烟青虫、甜菜夜蛾、美洲斑潜蝇。每隔5～7天喷1次，连喷3次。 ②物理防治：保护地可设置黄板或黄筒诱杀白粉虱、烟粉虱、蚜虫、美洲斑潜蝇等对黄色有趋性的害虫，或复盖银灰色地膜驱避蚜虫。③生物防治：积极保护利用天敌，发现粉虱成虫时，可释放丽蚜小蜂；
生物药剂，用1.8%虫螨克浓可溶性水剂，或2%菌毒克（宁南霉素），或72%农用硫酸链霉素可溶性粉剂，或5%卡死克乳油等生物制剂防治病虫等。
大力应用设施栽培技术，提高蔬菜的商品价值地膜覆盖技术，小拱栩、塑料大拥的利用，遮阳网、防虫网覆盖栽培，已被广大的农民所掌握及应用。在条件好的城市还可应用可控温、湿、气的大棚，打破了种菜要看季节气候的传统习惯，其商品价值大大提高。设施栽培还能通过人为控制气候、土壤（基质）条件，减少和预防病虫害的发生，使无公害蔬菜生产成为现实。在棚内种植的菜椒若发现有害虫为害，可人工释放一些天敌控制害虫发生，以减少喷施杀虫剂的次数，使蔬菜产品更。
当前在蔬菜生产中病虫害的防治往往只是把重点放在作物发病后或虫害发生后采用药剂防治，农药的用量一年比一年大，毒性越来越高，残留期越来越长。蔬菜的“、优质”生产受到一定的制约。因此重新强调农业技术措施在蔬菜生产中的重要意义，能达到事半功倍的作用。
一、生物源农药
生物源农药指直接利用生物活体或生物代谢过程中产生的具有生物活性的物质或从生物体提取的物质作为防治病、虫、草害和其他有害生物的农药。具体可分为；植物源农药、动物源农药和微生物源农药。如：BT、除虫菊素、烟碱大蒜素、性信息素、井岗霉素、农抗120、浏阳霉素、链霉素、多氧霉素、阿维菌素、芸苔素内脂、除螨素、生物碱等。
二、矿物源农药（无机农药）
有效成分起源于矿物的无机化合物的总称。主要有硫制剂、铜制剂、磷化物。如硫酸铜、波尔多液、石硫合剂、磷化锌等。而毒性较大、残留较高的砷制剂、氟化物等不在本推荐范围之内。
三、有机合成农药
限于毒性较小、残留低、使用的有机全成农药。推荐经过多年应用证明使用的菊酯类、部分中、低毒性的有机磷、有机硫等杀虫剂、杀菌剂及部分中低毒性的二苯醚类除草剂等等。如：氯氰菊酯、溴氰菊酯、乐果、敌敌畏、辛硫磷、多菌灵、百菌清、甲霜灵、粉锈宁、扑海因、甲硫菌灵、抗蚜威、禾草灵、稀杀得、禾草克、果尔、都尔等。高残留的有机氯类农药、二次中毒的氟乙酰胺、代谢物为“三致”物的乙撑硫脲等诸类农药不在推荐之列。
目前，生产无公害蔬菜，完全不用农药、植物激素和化肥还难以做到，但必须严格控制使用，允许有限度地使用高效、低毒、低残留的有机化学农药，严禁使用剧毒、高毒、高残留及具有“三致（致癌、致畸、致突变）”作用的农药。提倡使用高效、低毒、低残留化学农药，并与其他防治措施配合使用，对化学农药进行科学筛选，优化配组。严格执行农药使用标准，特别是要严格掌握蔬菜收获前农药使用的间隔期。坚持采用病虫害达标防治的原则，达不到防治标准不要用药，克服盲目乱用农药的不良习惯。病虫害的防治要从育苗田抓起，控制和减少用药次数，确保蔬菜体内有毒残留物质不超过国家规定标准。
禁用高毒高残留农药
在蔬菜病虫害防治中，可以使用的化学农药种类很多，但必须严格控制，禁止使用高毒高残留农药。例如三九一一、一六O五、一O五九、六六六、DDT、呋喃丹、甲基异硫磷、甲胺磷、磷化锌、氧化乐果、久效磷、杀虫脒、三氯杀螨醇、氟乙酰胺、有机汞制剂等剧毒农药，这些都严禁使用。
允许使用的防治蔬菜真菌性病害药剂
生产无公害蔬菜允许使用的防治蔬菜真菌病害药剂有：75%百菌清600倍液、70%代森锰锌500倍液、80%乙膦铝500倍液、75%甲霜灵800倍液、72%克瘟600倍液、58%甲霜灵锰锌600倍液、50%速克灵1500倍液、50%扑海因1000倍液、50%多菌灵500倍液、50%农利灵500倍液、50%多霉灵1000倍液、50%甲基硫菌灵500倍液、64%杀毒矾500倍液、34%绿路铜500倍液、80%炭疽福美500倍液等。其中，多菌灵（多菌霉威）和杀毒矾为复配药。药剂喷雾时一般每亩用药液50～70公斤，苗期或叶菜类用量少些。
允许使用的粉尘类药剂
允许使用的粉尘类药剂有：20%（或40%）百菌清烟雾剂300克/亩、50%百菌清粉尘1公斤/亩、10%（或20%）速克灵烟雾剂300克/亩、10%灭克粉1公斤/亩，以及扑海因烟雾剂和敌托粉等。另外，防治蚜虫，还可使用灭蚜烟剂350克/亩。粉尘类药剂多用在保护地内施用，不但药效高，而且不增加棚室内的湿度，从而可减轻病害的发生。
允许使用的防治蔬菜细菌性病害药剂
允许使用的防治蔬菜细菌性病害药剂有：500～1000万单位农用链霉素4000倍液、50%琥胶酸铜500倍液、30%DT杀菌剂、50%丰护安500倍液、27%铜高悬浮剂，34%绿乳铜500倍液、77%可杀得500倍液等。
允许使用的防治蔬菜病毒病药剂
允许使用的防治蔬菜病毒病的药剂有：菌毒清300倍液加50%辟蚜雾2000倍液（兼治蚜虫）、5%菌毒清300倍液、1.5%植病灵500倍液、83-1增抗剂200倍液、硫酸锌800倍液、绿芬威1号1000倍液、20%病毒A500倍液、抗毒剂1号400倍液、抗毒素500倍液、磷酸三钠500倍液等。同时，可在叶面喷施牛奶、葡萄糖，也可喷施含磷、钾、锌的叶面肥。另外，在接种病毒疫苗时，如分苗期用100倍液弱病毒疫苗14N蘸根半小时，可预防番茄病毒病。
允许使用的防治蔬菜害虫的药剂
防治潜叶蝇药剂：25%阿克泰水分散粒剂3000～5000倍液、25%爱卡士1000倍液、20%菊马乳油2000倍液、21%灭杀毙乳油3000倍液等。另外，还可用爱福丁、绿菜宝、灭蝇胺、安绿宝、虫蟎\光、赛凯（一般每亩用药液70公斤），也可利用黄板诱杀成虫。
防治白粉虱药剂：25%阿克泰水分散粒剂2500～5000倍液、25%扑虱灵2000倍液、10%万灵1000倍液（每亩用药液60公斤），也可用灭蚜灵烟剂350克/亩。
防治茶黄螨药剂：73%克螨特1000倍液、25%螨猛1500倍液、10%螨死净3000倍液、1.8%齐螨素8000～10000倍液、15%哒螨灵2500～3000倍液等。
防治蚜虫药剂：5%阿克泰水分散粒剂5000～10000倍液、25%爱卡士1000倍液、10%万灵1000倍液、50%辟蚜雾2000倍液、10%吡虫啉4000～6000倍液、10%啶虫脒300倍液，也可用灭蚜烟剂250克/亩熏烟。另外，还可用银灰色物品驱蚜或黄板诱杀。
防治棉铃虫与菜青虫等药剂：25%功夫乳油5000倍液、天王星（联苯菊酯）10%乳油1000倍液、灭杀毙3000倍液（一般每亩用药液50公斤）。另外，对其成虫可进行诱杀。