针对大豆根腐病我们要选择合适的农药来进行防治，这样才能大豆生长不受影响。
1．选用抗病品种。
2．与玉米、谷子、甘薯等非寄主作物轮作。
3．播种时增施农家肥、钾肥、磷肥等。
4．播种时施甲霜灵颗粒剂，使大豆根吸收可防止根部侵染。
5．播种前用种子重量0．3％的35％甲霜灵粉剂拌种。
6．加强田间管理，及时深耕及中耕培土除草，雨后及时排除积水，防止湿度太大。
7．发现病株及时拨出，病株残体，并在病株栽植穴及四周撒生石灰消毒。
8．该病发生后，很难，应以预防为主。预防可选用40％根腐灵400倍液，或70％甲基硫菌灵可湿性粉剂1000倍液，或58％瑞毒霉可湿性粉剂 600倍液，或50％多菌灵可湿性粉剂400倍液，或75％百菌清可湿性粉剂600倍液，或77％可杀得可湿性粉剂600倍液，或64％杀毒矾可湿性粉剂 900倍液，以上任何一种农药加氨基酸（大豆健粒饱或三天绿等）液肥600倍液，加黄腐酸盐500倍液，加生根粉1000倍液喷施。每7天喷1次，连续喷 2-3次，交替使用，重点喷洒植株的主茎基部。如用以上药液灌植株根部，效果更佳。
(1)大豆无免疫和高抗根腐病品种，可选用发病轻的高产、优质的大豆品种，适时晚播，播种深度不能超过5厘米。(2)合理轮作，实行与禾本科作物3年以上轮作，严禁大豆重迎茬。(3)施足底肥和及时进行中耕培土。(4)药剂拌种，推迟侵染期，常用药剂有含有多菌灵、福美双和杀虫剂的大豆种衣剂拌种;或用适乐时加阿普隆按比例拌种;或用宁南霉素水剂拌种。