设施萝卜基肥在施用上需要遵循下面几点，这样肥料的利用率才会得到一定的提高。
设施栽培萝卜具有生长快，生育期缩短，产能提高的特点。因此，在施肥技术上，要坚持以促进地下部和地上部协调生长为重点，以优质高产为目标。据生产测定，每生产1000千克萝卜，需从土壤中吸收纯氮2.1～3.1千克、五氧化地磷0.8～1.9千克、氧化钾3.8～5.6千克。萝卜是喜钾作物，三要素中需钾多。萝卜在不同生育期对氮、磷、钾的吸收量差别很大，一般幼苗期吸氮量较多，磷钾的吸收量较少；进入肉质根膨大前期，植株对钾的吸收量显著增加，其次为氮、磷；到了肉质根膨大盛期是养分吸收高峰期，吸收高峰期对营养的需要是萝卜优质高产的关键。此外，萝卜对硼素比较敏感，在肉质根膨大前期和盛期，采用叶面喷施硼肥，可有效规避萝卜生理病害，改善萝卜的品质。其主要施肥方法是：
基肥要足。萝卜的根系发达，需要施足基肥，在播前结合深翻，每亩施入腐熟的有机肥1000～1500千克，草木灰50千克，过磷酸钙30千克，提倡有机肥与无机肥配合施用，偏施化肥则容易产生苦味。
追肥要巧。即在施足基肥的基础上，进行巧妙追肥。原则是凡生长期短的可适当减少追肥，而生长期长的则要分期追肥，但追肥应以肉质根的膨大为中心，并掌握适时，分期、分量追肥，做到两头轻、中间重。一般次追肥在幼苗期进行，当苗有两片真叶展开时，追施少量的化肥，每亩250千克尿素。第二次追肥在大破肚时期进行，在追施氮肥的同时还要追施磷、钾肥，每亩各50千克。中小型萝卜在追两次肥后基本满足以后生长需要，除了在肉质根膨大期适当追肥外，不必再过多追肥。大型萝卜在露肩时需追施氮肥，每亩追施尿素150千克。在肉质根膨大期还要追施钾肥一次，每亩可施用草木灰150千克。