玉米秃顶其中有一部分原因可能是品种的遗传特性。尽管玉米果穗秃顶属于数量遗传性状，有些品种由于遗传上的特质，比较容易产生秃顶果穗，有些品种则不易产生秃顶果穗。
不当的栽培管理措施和不良环境条件的影响。有的品种对种植密度非常敏感，种植密度过大时，由于个体营养发育不良，灌浆期田间郁闭，通透性差，使得果穗顶部籽粒得不到足够的营养，形成秃顶。
营养元素缺乏，例如缺磷钾，也会加重玉米秃顶。玉米生长后期缺肥，籽粒发育到中途便停止生长，使玉米果穗尖部秕粒增多而变成秃顶。
不良的环境条件，例如高温也会造成秃顶。玉米在开花授粉期受高温伏旱，抽丝时间推迟，花粉盛散期已过，使雌穗尖部花丝未授到粉而秃顶。授粉期间阴雨过多，使花粉散不开，遇水花粉粒破裂而死，使雌穗花丝未授到粉而成秃顶。
为了减轻玉米秃顶造成的危害，生产上除了选用不秃顶的品种外，还可采取以下措施：
合理密植 根据品种的生理特性，采取合理的种植密度，使玉米群体具有良好的通风透光条件，使玉米个体得到良好的发育，减轻玉米秃顶的发生。
重施攻穗肥 玉米追肥应本着前轻、中重、后补的原则。玉米长到15片叶左右时，可随浇水亩施尿素10公斤或硝铵10~15公斤。在玉米抽穗至灌浆期，每亩用0.25公斤磷酸二氢钾和0.5公斤尿素兑水40~50公斤，于下午喷洒于叶面，进行根外施肥，可显著减少秃顶。
去雄 玉米去雄后，减少了水分和养分消耗，促使果穗粗长，籽粒饱满。同时，改善了玉米上部通风透光条件，提高了光合效率，减轻了玉米螟的危害。去雄时间应以雄穗刚刚抽出顶叶尚未散粉时为宜。去雄数量可隔行或隔株去雄。不宜太多，否则会使授粉不良，造成空穗，特别是玉米地周围4~5行不宜去雄。
人工辅助授粉 人工授粉应在雄穗散粉末期进行，一般进行2~3次即可。时间应在上午10时左右进行。方法是两人拉一条绳子，顺着行间走动，使绳子带动雄穗摇摆，或者将花粉接到授粉器内，对准雌穗上花丝，轻轻震动，使花粉粒均匀落在花丝上。
剪短花丝 玉米雌花丝露出苞叶后，花粉自落丝上而授粉，雌花授粉后，花丝即萎缩。但往往因花丝不齐，上部抽出较晚，有些花丝得不到花粉就继续生长，直到10~15厘米长。由于花丝太长，互相遮盖，影响下面花丝授粉。因此，应将花丝剪短，只留1.5~2厘米，使花丝呈馒头状或马蹄状，前短后长，有利授粉，可减少秃顶。
一是精选良种。要选择适合本地栽植的高产、籽粒饱满、生活力强的包衣种子，而且在播前要用晾晒以及拌种等方法处理。种植密度一般在4000株左右，肥力较差的田适当增加株数，肥力较好的田适当减少株数。同时，采用宽窄行栽植，以免因肥、水、光不匀而出现弱苗。二是合理施肥。施肥应氮、磷、钾配合，并配合适当施用微肥。肥力低的地块要重施追肥，但要注意前重后轻，防止贪青晚熟。苗期要控制浇水，促进幼穗分化和缩短抽雄吐丝的间隔时间，增加授粉机会。在施肥上做到:重施底肥。尽可能一次施足农家肥、磷钾肥。中等肥力田块，每亩应施入优质农家肥750~1000公斤、尿素6公斤，过磷酸钙50~60公斤，硫酸锌1.5~2公斤，肥力较差或肥力较好的田块在此基础上适当多施或少施。巧施穗肥。在玉米抽穗前10天，也就是常说的大喇叭口期，一般每亩追施碳铵25~30公斤，雌穗开始吐丝时，每亩追施尿素3公斤。喷施锌肥。在玉米拔节期用2%硫酸锌溶液，进行叶面均匀喷雾。三是浇抽雄开花水。玉米抽雄前15天对水敏感，遇旱土壤含水量低于田间持水量80%时，应立即浇水。有利于玉米授粉和灌浆。四是人工辅助授粉。玉米开花盛期，应抓紧时间在上午露水干后，雄花开始大量散粉时进行。可采用拉绳法或摇株法，每隔2~3天进行一次，连续2~3次，可防止秃顶发生。