贮藏好蔬菜种子，是保持种子的生活力和发芽率，苗全、苗齐、苗壮的关键。因此，一定要把蔬菜种子贮藏好。具体要做到五忌：
一忌混杂 各种蔬菜种子在收获时，一定要分收、分打、分晒、分存。贮藏前，必须逐一贴上标签，注明品种了收获日期，切忌混杂。
二忌潮湿 蔬菜种子在充分晒干后，要存放在干燥通风处，装在瓶内或缸内，摆在离地面1米以上的地方，不能被雨淋或接触潮湿的物体。
三忌虫蛀 蔬菜种子在贮藏期间，会受到多种害虫的蛀食，避免的方法是尽量使种子干燥，造成不利于害虫生活的条件。因此，应在贮藏一段时间后，就要利用中午阳光曝晒一次，防止害虫滋生危害。
四忌烟熏 因烟中含有大量二氧化碳和其它有害物质，故蔬菜种子被烟熏后，会破坏种胚的活力。所以，不能把蔬菜种子贮存在有烟火的房间里，例如厨房等。
五忌憋气 蔬菜种子在贮藏过程中，呼吸作用仍在进行。因此，不能将蔬菜种子装入密封的容器内。如果蔬菜种子数量多，贮存时间又长，用来贮存的瓶、罐等容器，不宜装满，应留有空隙，并隔些日子晾晒一次，以便通风换气，防止返潮。
(一)带荚、整株贮藏。如对菜豆、刀豆、辣椒等成熟后不自行开裂的短角果连株拔下，捆扎成把，挂在阴凉通风处，用时采摘脱粒。这种挂藏方法优点是简便，易行，适合农村自家园田留种。(二)将自然晾晒精选的蔬菜种子放在牛皮纸袋或布口袋中，也可放于干燥的容器内，放置在干燥通风处，用时取出，这种贮藏方法保存的种子时间长，发芽率也较高。(三)在低温、干燥、真空条件下贮藏。把经过加工的种子放在真空、密闭、低温的条件下贮藏，一般可放在有防腐涂料的塑料纸口袋中，或放在密封的铁罐内，这样贮藏可存放2，3年以上，其发芽率仍可达到95%以上。来源:(三)在低温、干燥、真空条件下贮藏。把经过加工的种子放在真空、密闭、低温的条件下贮藏，一般可放在有防腐涂料的塑料纸口袋中，或放在密封的铁罐内，这样贮藏可存放2，3年以上，其发芽率仍可达到95%以上。
(一)带荚、整株贮藏。如对菜豆、刀豆、辣椒等成熟后不自行开裂的短角果连株拔下，捆扎成把，挂在阴凉通风处，用时采摘脱粒。这种挂藏方法优点是简便，易行，适合农村自家园田留种。(二)将自然晾晒精选的蔬菜种子放在牛皮纸袋或布口袋中，也可放于干燥的容器内，放置在干燥通风处，用时取出，这种贮藏方法保存的种子时间长，发芽率也较高。(三)在低温、干燥、真空条件下贮藏。把经过加工的种子放在真空、密闭、低温的条件下贮藏，一般可放在有防腐涂料的塑料纸口袋中，或放在密封的铁罐内，这样贮藏可存放2，3年以上，其发芽率仍可达到95%以上。来源:(三)在低温、干燥、真空条件下贮藏。把经过加工的种子放在真空、密闭、低温的条件下贮藏，一般可放在有防腐涂料的塑料纸口袋中，或放在密封的铁罐内，这样贮藏可存放2，3年以上，其发芽率仍可达到95%以上。
密封法
对留存的少量种子可放在纸袋或布袋里，然后存于玻璃瓶或塑料桶内。在容器底部要放上生石灰、木炭等干燥剂，上面放种子袋，然后加盖密闭，放在阴凉干燥处。
高吊法
如种子带荚或整枝储藏时，要将收获后的蔬菜种子捆扎成把，挂在阴凉通风处，用时采摘脱粒；种子直接储藏时，需晾干透后用纱布缝制的小布袋盛装，并把布袋吊于通风阴凉的屋顶上，这样不仅增强通透性，便于种子呼吸，而且种子不易受潮、变质。
堆垛法
留种数量较多的品种可用麻袋包装，按品种堆垛储藏，每堆下面应有垫板，以利通风。堆垛高度一般不宜超过6袋，细小种子不宜超过3袋，隔一段时间要翻动一下。否则，底层种子易被压伤，发芽率降低。