草木灰是碱性肥料，在使用和保存过程中要注意以下四点：
一、草木灰是碱性肥料，不宜与硫酸铵和硝酸铵混存、混用。硫酸铵、硝酸铵和碳酸氢铵都是铵态氮肥，若将它们和草木灰混在一起，就会使氮肥里面的氮变成氨气跑掉。草木灰在与酸性肥料同时使用时，一定要注意不可将它们混在一起。
二、草木灰不宜与人粪尿、家畜粪尿混存。农村习惯将草木灰倒入茅坑或猪圈内贮存，这种做法是错误的。家畜粪尿、人粪尿等是一种迟效酸性氮肥，如将含碱性的草木灰倒进含酸性的家畜粪尿、人粪尿上，酸碱中和使氨挥发，从而降低肥效。草木灰与家畜粪尿混存1周，就可使粪尿中的铵态氮素损失一半以上，混存时间越长，氮素损失越多。
三、草木灰中的养分易溶于水，为保存灰分，应单独贮存在灰库或灰棚等遮风避雨的地方，以防风吹雨淋。雨淋后的灰分，钾素会受到严重的损失。
四、草木灰也不能与过磷酸钙混存和混用，混后会降低磷的有效性。