黄瓜发生畸形有两种情况：
（1）瓜条未端变小，可能由于栽培生态（营养和温度变化）等综合因子引起的一种非侵染性生理病害。建议生产上加强栽培管理措施，喷施壮瓜蒂灵，使瓜蒂增粗，强化营养定向输送量，促进瓜体快速发育，瓜型漂亮，汁多味美；生长周期不落花、不落瓜、无裂瓜、无畸形瓜。
（2）瓜条表面有呈深、淡绿色的突起（或瘤状斑块），凹凸、畸形，是由于植株感染了病毒病，引起果实坏死病变，在有这种畸形瓜时，往往植株新叶也是呈浓、淡绿色相间斑纹的花叶，叶小、叶面凹凸不平、皱缩或畸形等症状。
病毒病害的防治，应及早做好综合治理的预防措施，一旦发生流行，就难以控制。蔬菜病毒病防治，使用新高脂膜400倍液和护树大将军喷洒，消毒杀菌，封闭病毒复制和传播路径，，促使黄瓜健康茁壮成长。
在黄瓜生产上，会发生果实畸形，其中
①瓜条末端变小，会园艺专家认为可能由于栽培生态（营养和温度变化）等综合因子引起的一种非侵染性生理病害。为此，建议生产上加强栽培管理措施，喷施壮瓜蒂灵，使瓜蒂增粗，强化营养定向输送量，促进瓜体快速发育，瓜型漂亮，汁多味美；生长周期不落花、不落瓜、无裂瓜、无畸形瓜。
②瓜条表面有呈深、淡绿色的突起（或瘤状斑块），凹凸、畸形，是由于植株感染了病毒病，引起果实坏死病变，在有这种畸形瓜时，往往植株新叶也是呈浓、淡绿色相间斑纹的花叶，叶小、叶面凹凸不平、皱缩或畸形等症状。病毒病害的防治，应及早做好综合治理的预防措施，一旦发生流行，就难以控制。蔬菜病毒病防治，使用新高脂膜400倍液和护树大将军喷洒，消毒杀菌，封闭病毒复制和传播路径，，促使黄瓜健康茁壮成长。
（1）曲形瓜：产生曲形瓜有生理或物理原因。生理原因多因营养不良，植株瘦弱造成，如光照不足、温度、水分管理不当，或结瓜前期水分正常，结瓜后期水分供应不足，或伤根，病虫为害引起。尤其是高温，或昼夜温差过大过小，光照少，地温低等条件易发生。有的花期子房就表现出弯曲状态，随幼果长大弯曲加重，曲形瓜在初或的果穗发生多。此外，雌花或幼果被架材及茎蔓等遮阴或夹长等物理原因也可造成畸形果。
（2）尖嘴瓜和大肚子瓜：早春保护地中传粉昆虫少，黄瓜不经受粉，也能结实，这是单性结实，没有种子。这种瓜营养条件好，能发育成正常果实，反之则形成尖嘴瓜。当雌花受粉不充分，受粉的先端先膨大，营养不足，或水分不均，就会形成大肚瓜。有的在营养充分情况下，仍发育成正常瓜。有时高温持续时间长，黄瓜果实因高温为害也成畸形怪状。
（3）细腰瓜：当营养和水分有时好，有时供应不正常，反应在同化物质积累不均匀，就会出现细腰瓜。此外，黄瓜染有黑星病，或缺硼，也会出现畸形瓜。
（4）苦味瓜：有些黄瓜出现苦味，这是由于苦味素（CloH2805）在黄瓜中积累过多所致，生产中氮肥施用过量，或磷、钾不足，特别是氮肥突然过量很易出现苦味，黄瓜对氮磷钾吸收基本遵循5：2：6的比例，否则就会出现生育不平衡，造成徒长，或出现座果不齐或畸形，或在侧枝上，弱枝上出现苦味瓜。此外，地温低于13℃，细胞透过性减低，致养分和水分吸收受抑，也会出现苦味或变形。棚温高于30℃持续时间过长，致同化能力减弱，损耗过多或营养失调都会出现苦味瓜，有时棚内或土壤湿度过大形成“生理干旱”苦味素易在干燥条件下进入果实。苦味还有遗传性，叶色深绿的苦味多。