病虫害的发生是每种蔬菜都会都会经历的，温室黄瓜也不例外。
1.农业防治。与非瓜类作物轮作3年以上，加强田间管理，提高植株抗性，减少病虫害的发生。及时摘除病叶、病果，拔除病株，带出地片深埋或销毁，减少病虫害传播源。
2.物理防治。采用防虫网阻断虫源，采用黄板诱杀蚜虫和白粉虱，每亩放黄板30～40块。
3.生物防治。一方面积极保护利用天敌防治病虫害，如在温室内释放蚜茧蜂防治蚜虫、丽蚜小蜂防治白粉虱等；另一方面使用生物农药如除虫脲、多抗霉素、武夷菌素、等防治病虫害。
4.害虫防治。防治蚜虫、白粉虱可用阿克泰水分散粒剂、吡虫啉等喷雾。
5.真菌性病害。霜霉病、疫病：可选用达克宁(百菌清)、阿米西达、克露、普力克、金雷或世高等喷雾。灰霉病可选用乙烯菌核利、扑海因(异菌脲)、速克灵(福霉利)等喷雾。白粉病选用阿米西达、爱苗、世高(苯醚甲环唑)、加收米(春雷霉素)、翠贝(醚菌酯)等喷雾防治。
6.细菌性病害。细菌性叶斑病、茎基腐病等可选用农用链霉素、可杀得、加瑞农(春雷霉素)等喷雾防治。
7.病毒病。可选用病毒A、病毒灵、氨基寡糖素等喷雾防治。