食用菌提高产品质量水平，应采取综合防治措施控制病虫危害。其病虫害综合防治措施主要有：
切断病虫害传播途径。食用菌栽培中病虫害的来源途径有三条：一是菌种带虫，带病源；二是培养料和覆土带虫、带病源；三是菇房（棚）内外自然传播。切断这三条传播渠道是病虫害综合防治的重中之重。
环境控制，减少病虫害发生。1.降低料温：如双孢菇发菌料温控制在21℃以下，可有效防治胡桃肉状菌；金针菇发菌温度控制在20℃以下；平菇菌袋在20℃以下可以防止菌袋污染。2.加强通风换气。通风换气是的空气消毒方式，切勿造成闷湿的出菇环境，不通风有百害而无一利。3.光线调节。不同品种有不同的光照度要求。如双孢菇应偏暗一些，而白灵菇则需要强一些。
农艺防治措施。不同的土壤有不同的微生物区系，不同的生态环境有不同的生物群落。实践表明，土棚栽培一般头年好，二年差，原因就是土棚的生态环境越来越差，也就是说病菌多了、虫害多了、空气质量也不好了。为此，必须改善生态条件，优化出菇环境，减少和降低病虫害的发生。
关于食用菌病害的综合防控，你有什么办法？
食用菌杂菌
常见和危害较严重的杂菌主要有要木霉、链孢霉、毛霉、曲霉、青霉、细菌等 20 多种。
一、木霉
1、症状表现：木霉俗称绿霉，几乎能为害所有的食用菌，其对食用菌的为害表现为：污染培养料与食用菌争夺营养和空间；分泌霉素杀伤、杀死寄主；木霉菌丝接触到寄主菌丝时将寄主菌丝缠绕切断。
2、防治方法：
①培养室、栽培场所应保持低温，空气相对湿度控制在 85%左右，并保持清洁卫生，通风良好。
②一旦发生木霉为害 ，要立即通风降湿 、菌筒感染初期 ，可采用 2%甲醛溶液或 3%---5%的石碳酸注射，抑制木霉的扩张。
部分感染成熟的菌筒可挖除污染部位，在处理部位上撒施石灰粉或石硫合剂或波尔多液等，也可用克霉灵，多菌灵，施保功，甲基硫菌灵等杀菌剂防治。
如用50%多菌灵 1000 们拌料可预防木霉的发生 ，但不宜在猴头 、木耳 、银耳上使用多菌灵。
二、链孢霉
1、症状：链孢霉俗称红粉病，红面包霉病，为食用菌生产中常见杂菌，可污染所有的食用菌，是一种顽强、速生的气生霉菌，培养料受污染后，还在料面迅速形成橙红色或粉红的霉层。
2、防治措施：尽量避开闷热，潮湿的夏季高温期进行生产，注意搞好环境卫生。一旦出现桔红色块状分生孢子团，用湿布或湿纸小心包好拿掉，浸入药液中或深埋，切勿用喷雾器直接对病菌喷药，以免孢子飞散；也可及时滴上适量的甲醛，煤油或柴油，然后用薄膜包扎，可使霉糜烂死亡。发菌后期受害，可将受害菌袋埋入深 30-0 厘米透气差的土壤中， 经 10-20 天缺氧处理后，能减轻病害可出菇。多菌灵、施保功等杀菌剂可控制链孢霉的生长。
三、曲霉与青霉
1、症状：曲霉俗称黄霉、绿霉、黑霉等。
曲霉的种类很多。
黑曲霉的菌落为黑色疏松的果粒状；黄曲霉黄色、黄绿色，呈褐绿色；灰绿曲霉初白色后呈灰绿色；青霉，其种类多、菌落呈灰绿色、黄绿色或蓝色粉状霉层。曲霉、青霉均属常见的杂菌，它们与食用菌争夺营养、水分，并分泌霉素抑制食用菌生产。
2、防治措施：加强培养室的通风、降低温度，减少空气相对湿度，局部发生可用 5-10%的石灰水冲洗 ，其它防治方法可参考木霉防治。
食用菌虫害
虫害主要有：菇蚊、菇瘿、跳虫、螨类、线虫类等。主要防治办法有以下几种：
1.尽量采用发酵或熟料栽培，控制培养基地内虫口；双孢菇的栽培床要采用发酵料。拌料时加入0.5%食盐、3%石灰、5%～8%草木灰等，有较好的驱虫和预防效果。
2.菌袋或培养料入棚前，要进行空棚消毒。
3.畦栽料面发生时，喷洒1%～2%的洗衣粉溶液，对菇蝇、成螨、老幼螨均有极强的触杀作用。
4.利用一些害虫喜欢在透光、阴凉等环境下活动的规律，将灭害灵等液喷在透光的塑料薄膜上，盖在畦床上，每天1～2次，连喷3～4次，可杀死飞虫成虫。
5.在虫害菇房内安装几个15瓦灯泡或黑光灯，下面放一盆水，向水中滴入煤油，对诱杀菇蚊、菌蚊、黑腹果蝇等成虫效果极好。
6.糖醋液诱杀：将糖、醋、白酒、敌敌畏、水按2∶3∶4∶1∶90的比例配成药液，用纱布或棉球浸药、拧干、置于料面上，害虫闻到糖醋味即爬到药布或药棉上而被毒死。
7.将害虫喜欢吃的食物和毒药混拌，如将醋、糖、杀虫剂、炒黄的麸皮按1∶5∶10∶84的比例拌匀，撒于菇床四周及料面让其取食；对菇蝇、菇蚊、线虫等害虫也可用草木灰＋除虫菊（1克/平方米）在料面上均匀撒一层，连撒2～3天，效果很好，既可治虫也可防病。
8.在低温季节，对畦床内螨类等害虫等可采取"先引诱后杀灭"的方法：晴天的早晨，先在床面喷一遍糖醋液，盖上薄膜，拉开草帘、升温，这时会有大量害虫从深处爬到床面或薄膜上；下午，适时揭掉薄膜，带出菇棚，用水洗除附着的虫子，同时用高剂量低毒杀虫剂喷杀床面后覆膜。如此连续3～5次，便可消除危害。
9. 选用生物药剂防治，严格执行间隔期：菇床、菌袋用药，必须选用高效低毒、低残留的无公害药剂，用药应在菇体采摘后进行，以免造成药害或残留超标，用药后要适当控制出菇时间，严格执行农药间隔期，避免子实体中药剂残留超标。生物药剂可选用0.1％鱼藤精，或5％天然除虫菊素，或Bti（苏云金芽孢杆菌以色列变种）粉剂等。
切断病虫害传播途径。食用菌栽培中病虫害的来源途径有三条：一是菌种带虫，带病源；二是培养料和覆土带虫、带病源；三是菇房（棚）内外自然传播。切断这三条传播渠道是病虫害综合防治的重中之重。
环境控制，减少病虫害发生。1.降低料温：如双孢菇发菌料温控制在21℃以下，可有效防治胡桃肉状菌；金针菇发菌温度控制在20℃以下；平菇菌袋在20℃以下可以防止菌袋污染。2.加强通风换气。通风换气是的空气消毒方式，切勿造成闷湿的出菇环境，不通风有百害而无一利。3.光线调节。不同品种有不同的光照度要求。如双孢菇应偏暗一些，而白灵菇则需要强一些。
农艺防治措施。不同的土壤有不同的微生物区系，不同的生态环境有不同的生物群落。实践表明，土棚栽培一般头年好，二年差，原因就是土棚的生态环境越来越差，也就是说病菌多了、虫害多了、空气质量也不好了。为此，必须改善生态条件，优化出菇环境，减少和降低病虫害的发生。
化学防治。化学防治一般用于预防措施，在出菇期间禁止使用药剂防治，因为子实体的组织结构容易产生残毒，影响食用和出口。因此，在出菇期间禁止使用药剂防治，即使万不得已使用，只能在出菇前喷施，而且使用植物制剂、苦碱素等。