为了提高磷肥利用率，施用时可采取以下的几种措施：
(1)根据土壤条件施用不同性质的磷肥，不同的磷肥适用于不同的土壤。过磷酸钙是水溶性磷肥，适于大多数土壤，但施于中性土壤和碱性土壤效果更好；钙镁磷肥，碱性炉渣等弱酸溶性磷肥，应施于中性或酸性土壤；磷矿粉、骨粉等难溶性磷肥，在酸性土壤上施用才能发挥其肥效。土壤含有效磷愈低，施用磷肥的肥效就愈高。因此，瘠薄的缺磷土壤施用磷肥后增产的效果较明显。
(2)磷肥与氮肥配合施用。缺磷的土壤一般也缺氮，但若氮磷比例配合得好，可以使磷的利用率由13.8%提高到30%，氮磷比例以2：1为宜。
(3)集中施、近根施和分层施。磷肥在钙质土和酸性土中移动性小，并容易产生化学固定。因此，采用条施、穴施、沾根、拌种、叶面喷洒、基肥深施等，可减少磷肥与土壤的接触面积，并力求施近根部，才能更好地提高磷肥的利用率。
(4)与有机肥混合堆沤施用。难溶性磷肥(如磷矿粉)与绿肥、堆肥、泥炭一起堆沤腐熟后再施用。有机肥料在分解过程中产生的二氧化碳和有机酸，有助于磷肥中非水溶性的磷化合物转化为有效磷，同时还可防止水溶性磷被土壤中的钙、镁、铁、铝等离子所固定，这样可以提高难溶性磷肥的肥效。堆沤加入的磷肥一般为有机肥料的5%～10%。
由于南方大部分土壤偏酸性，对磷有很强的固定作用，一旦磷被固定后就失去了肥效性，因而大大降低了磷肥的肥效。所以我们一定要采取一些提高磷肥利用率的措施。
一、降低烤烟产量
过量施磷肥，烟株会从土壤中吸收过多的磷素营养，会促使叶片呼吸作用过于旺盛，消耗的干物质大于积累的干物质，造成繁殖器官提前发育，引起烟株早花，叶片小，产量低。
二、诱发土壤缺锌
若过量施用过磷酸钙，会使土壤里的锌与过量的磷作用，产生烟株无法吸收的磷酸锌沉淀，令烟株无法吸收，使烟株出现明显的缺锌症状；过量施用钙镁磷肥等碱性磷肥后，会使土壤碱化，造成锌的有效性降低，进而影响烟株对锌的吸收。
三、使烟株得磷失硅
过量施用磷肥后，还会造成土壤中的硅被固定，不能被烟株吸收，引起缺硅，若不能从土壤中吸收到较多的硅元素就会发生茎秆纤细、倒伏及抗病能力差等缺硅症状。
四、使烟株得磷缺钼
适量施用磷肥会促进烟株对钼的吸收，而过量施用磷肥，会导致磷和钼失去平衡，影响烟株对钼的吸收，表现出“缺钼症”。
五、造成土壤中有害元素积累
磷肥主要来源于磷矿石，磷矿石中含有许多杂质，其中包括镉、铅、氟等有害元素。施用磷肥会引起土壤中镉的增加，年增长量分别为0.15%~0.08%，且这种镉有效性高，易被作物吸收，给人畜造成危害。
六、造成土壤理化性质恶化
若施用过磷酸钙来补充磷肥，因过磷酸钙含有大量游离酸，连续大量施用，会造成土壤酸化。而钙镁磷肥含有25%-30%的石灰，大量施用会使土壤碱性加重，理化性质恶化。
烟田磷素营养过量，烟叶变老、变厚，支脉变粗，叶组织粗糙，油分少，易破损，因而影响品质。因此，磷肥并非愈多愈好，但过量的情况很少见，因为磷肥的利用率很低。
那么磷肥施用量以多少为宜呢？一般来讲，即使缺磷土壤上，每亩施用量也不能超过40㎏，以30—35㎏为宜。鉴于永定富磷土壤，只需施用含磷7%的烟草专用肥，即可满足烟株对磷素营养的需要。
1、根据土壤养分化验结果确定磷肥施用量。根据土壤养分丰缺指标，当土壤有效磷含量低于10mg/Kg时（低水平），通过增施磷肥提高作物产量和培肥地力，磷肥施用量为作物带走量的2倍；当土壤有效磷含量为10--20mg/Kg时（中等水平），磷肥施用目标是维持现有土壤有效磷水平，磷肥施用量等于作物的带走量；当土壤有效磷含量在20 --30 mg/Kg时（较高水）和30mg/Kg以上（极高水平），磷肥用量分别为作物的带走量0.5倍和完全不施，减少大量施用磷肥造成的经济浪费和农业环境平污染。一般远离村庄的瘠薄地块，新平整的生土地块，常年不施农家肥的地块，应当优先施用磷肥；肥田、肥地和往年连续大量施用磷肥的地块可适当少施；旱地、黄泥田、冷浸田等施用磷肥增产显著，应重施磷肥使用。
2、应施用于对磷反应敏感的作物上，这些作物主要是水稻、油菜、小麦、花生、豆类、薯类、瓜类等，施用磷肥可以达到以磷增氮的效果。
3、改撒施为集中条施或穴施 。 磷肥要经过水的溶化和解离后，作物的根或茎叶才能吸收利用，所以施用时如把磷肥撒在地表上或干燥的土壤里，就会造成浪费和流失。因此，水稻施磷是用磷肥粘秧根，或深施于犁沟中；旱地作物施磷可采用穴施、条施，使磷肥集中在种子或根系周围。
4、磷在土壤中的移动性比较差，因此以底施效果好。
5、磷肥与有机肥（如农家肥）一起堆沤混合施用。磷肥很容易与土壤中的铁、铝、钙、镁等元素发生化学反应，变为难溶性磷肥，使磷肥的有效性降低。因此，把磷肥与有机肥一起混合堆沤，在堆积过程中，有机肥分解出的有机酸可以促进磷肥的溶解性，从而提高磷肥的有效含量，特别是钙镁磷肥与有机肥混合堆沤，可使钙镁磷肥中那些难溶性的磷转化为农作物易吸收的有效磷。
6、过磷酸钙、钙镁磷肥、磷矿石粉等磷肥应与氮、钾肥配合施用。这几种磷肥不含氮、钾营养元素，与氮、钾肥料配合使用可以协调作物对养分的需要，发挥氮、磷、钾之间的相互促进作用，其增产效果比单独施磷效果好。