果树施基肥以秋施效果，特别是对落叶果树效果更佳。秋季施肥料时应掌握以下要点：
选肥以有机肥、迟效肥为主，可以用厩肥、土杂肥、饼肥、草木灰等，适当配施氮肥、磷肥和钾肥，有机肥的施用量应占年施肥总量的90%以上。
肥料的施用量应根据果树大小、营养状况、挂果多少而定，每株施有机肥35～50公斤、过磷酸钙1～1.5公斤、尿素0.4～0.5公斤。
结合果园耕翻采用放射状沟施或环状沟施，施肥深度在40～50厘米。对苹果树、梨树施入要稍深，对桃树、葡萄树施入要稍浅，施肥后盖严覆土。
施肥后浇1～2次透水，既可使肥料有充足的水分迅速腐烂发酵分解，又能使果树在秋高气爽的季节不干旱。浇水后可用农作物秸秆、杂草等物覆盖保墒。
秋季温度较高，土壤微生物活力强，有利于肥料的分解和果树吸收营养，从而合成更多的有机养分，对来年春季萌发、抽梢、坐果等都有很好的作用。同时，还能增强树体的抗寒能力，有利于果树越冬。
1、注意掌握施肥时间苹果树秋施基肥一般在中晚熟品种采果前后，宜早不宜晚。此时气温高、雨量多，基肥有充足的时间分解，叶片功能尚未衰退，有较强的光合功能，养分回流到根中，正值果树根系生长的高峰，且断根容易愈合，并能生出大量的分生根和吸收根，有利于增加树体营养水平。
2、注意施肥的区域一般选在果树树冠的投影边缘及其稍远处，全园施肥也应距树干1米以外。从深度上来说，在距地表10～35厘米的范围内的根条占总根量的80%左右，施肥深度以50厘米左右为宜。
3、注意施肥方法无论是环状沟施、放射沟施或条状沟施，还是全园撒施，皆不能使肥料成团成块，应使腐熟好的有机肥、化肥等与根际土壤充分混合均匀，使肥料分散透气，缓慢释放出供树体吸收的养分，以提高养分的利用率。
4、注意保护根系尤其是保护好生长在各级侧根上的细根。开沟露出的大根翻过后，应将其充分舒展并埋在松土中，随翻随埋，严防长期风吹日晒把根抽干。同时，对断根要用利剪修剪，以利其早愈合生根。
5、注意多施有机肥连续施用有机肥，可有效改良土壤。优质丰产果园的有机质含量应达2%～3%，每公斤苹果施1.5～2公斤有机肥。
6、注意有机肥要腐熟将粪肥、草、秸秆等混合，加入适量水用稀泥封堆，然后高温堆沤处理，待肥料充分腐熟、养分初步分解后再施用。
7、注意合理配方果树对各种元素的需求有一定的比例，幼龄果树需磷量较多，一般为氮、钾的2倍，故氮、磷、钾可按1：2：1配制。进入盛果期以后，果树需要氮、钾的量较多，氮、磷、钾可按2：1：2配制。
8、注意适量增施微肥当微肥需求量不足时果树易患缺素症，缺铁会出现黄化病，缺锌会出现小叶病。常用的微肥有硫酸亚铁、硫酸锌及硼砂等。但要注意，硫酸亚铁直接施入土中会很快转化成不能溶解的化合物，故与有机肥同时施入效果较好。硼砂与有机肥、氮肥、磷肥等混合使用。
9、注意肥料的酸碱性若长期单一施用某种肥料，容易改变土壤的酸碱度，酸性肥料与碱性肥料不能同时施用。酸性肥料宜在碱性土壤中施用，如硫酸铵、过磷酸钙、氯化铵、氯化钾、硫酸钾等；碱性肥料宜在酸性土壤中施用，如草木灰、石灰氮、钙镁磷肥、钢渣磷肥和硝酸钠等。正确使用酸碱性肥料，可以提高肥料利用率，并逐步改良土壤，有利于果树根系的健壮生长。
一、注意时间
一般情况，选择在中晚熟品种采果之前。此时气温较高、雨量较多，基肥有充足的时间分解，叶片功能尚未衰退，有较强的光合功能，养分回流到根中，正值果树根系生长的高峰，且断根容易愈合，并能生出大量的分生根和吸收根，有利于增加树体营养。
二、注意区域
一般情况下，选在果树树冠的投影边缘或其稍远处，全园施肥也应距树干1米以外。从深度上来说，在距地表10～35厘米的范围内的根条占总根量的80%左右，施肥深度以50厘米左右为宜。
三、注意方法
无论是环状沟施、放射状沟施或条状沟施，还是全园撒施，皆不能使肥料成团成块，应使腐熟好的佐田氏有机肥或其他复合肥等与根际土壤充分混合均匀，使肥料分散透气，缓慢释放出供树体吸收的养分，以提高养分的利用率。
四、注意保护根系
保护根系，尤其是要保护好生长在各级侧根上的细根。开沟露出的大根翻过后，应将其充分舒展并埋在松土中，随翻随埋，严防长期风吹日晒把根晒干。同时，对断根要用利剪修剪，以利其早愈合生根。
五、多施用有机肥
连续施佐田氏有机肥，可有效改良土壤。优质丰产果园的有机质含量应达2%～3%，每公斤苹果施1.5～2公斤有机肥。但是有机肥施用时一定要注意完全腐熟，可配施佐田氏微生物菌肥，不仅可补充土壤有机质，其含有的61种复合功能菌还可充分地将有机肥分解为果树能够吸收利用的有机质。
六、合理配方
果树对各种元素的需求有一定的比例，幼龄果树需磷量较多，一般为氮、钾的2倍，故氮、磷、钾可按1：2：1配制。进入盛果期以后，果树需要氮、钾的量较多，氮、磷、钾可按2：1：2配制。
七、适当增施微肥
当微肥需求量不足时果树易患缺素症，缺铁会出现黄化病，缺锌会出现小叶病。常用的微肥有硫酸亚铁、硫酸锌等。但要注意，硫酸亚铁直接施入土中会很快转化成不能溶解的化合物，故与有机肥同时施入效果较好。