寒冬季节给蘑菇菇棚进行同通风则是一个很难的事，我们该怎样让菇棚进行通风呢？
给菇棚加强通风，尤其在保湿与通风发生矛盾的时候，应以通风为主，保湿为辅。低温季节的出菇阶段，人们大多重视保湿保温，而忽略了通风，据调研，现阶段下大多菇农的棚湿保持在90%以上，相当部分超过95%，在棚温保持稳定、棚湿较高、通风不足、二氧化碳浓度较高的的条件下，杂菌、病害极易发生并形成蔓延，有的甚至会形成暴发，笔者在长期食用菌研发实践中发现，通风问题所具有的重要性和易被广大菇农所忽视的现实，由此给实际生产所带来的危害，比其它因素给生产造成的损失要大得多，因此，近年来在指导生产时，笔者一直提倡并呼吁菇农加强通风措施，必要时应强制通风。
自然条件下，菇棚的通风应在上午9：00~10∶00至下午14∶00~15∶00的时间段打开通风孔或门窗，以程度地缩小棚内温差；有条件的可在菇棚安装排气（拔风）筒，使其底部距地面15厘米左右，顶端高出菇棚3米左右，需要通风时，打开底部，排气筒可自动抽气排出，否则，可堵住下部，停止排气即可。使用水温空调的菇棚，则基本没有通风不良之忧。
当菇棚杀菌消毒完成后，菇农还要注意及时进行通风，将棚室内的有毒气体排出棚外，防止以后食用菌生产时，有毒气体影响食用菌的生长。