在种植辣椒的过程中，辣椒会出现烂果的现象，造成辣椒烂果原因很多。大致有以下八种情况，生产中应根据不同原因“对症下药”及时防治。
软腐病引起的烂果。初呈水泽状淡暗绿色斑，后全果软腐，具恶臭，果皮变白，干缩后脱落或挂在枝上。其他部位很少症状。可喷施72%农用链霉素4000倍液或50%DT杀菌剂500倍液，7天1次，连喷2~3次。棉铃虫、烟青虫是传病媒介，要即使用联苯菊酯类农药喷杀。
炭疽病引起的落果。接近成熟时易染病。初呈水泽状黄褐色圆斑，中央灰褐色，上有稍隆起的同心轮纹，常密生小黑点。潮湿时，病斑表面常溢出红色粘稠物；干燥时，病部干缩成膜状，易破裂露出种子。叶片染病，初为水泽壮褪绿斑点，后变为绿褐色，中部浅灰色的小班。可选喷百菌清、甲基硫菌灵和新万生，以苯脐腐病引起的烂果。果实脐部受害，初呈暗绿色水泽状斑，后迅速扩大，皱缩，凹陷，常因寄生其他病菌而变黑或腐烂。可干着果后喷洒1%过磷酸钙或0.1%氯化钙。如病部变黑或腐烂，可按黑霉病或软腐病防治。
黑霉病引起的烂果。一般果余下发病，也有的从果面开始，初期病部颜色变浅。果面渐渐收缩，并生有绿黑色霉层。可喷50%DT杀菌剂500倍液或58%甲霜灵锰锌400倍液，7天1次，连喷2~3次。
灰霉病和菌核病引起的烂果。灰霉病以门椒、对椒发病较多，在幼果顶部或蒂部出现褐色水泽状病斑，后凹陷腐烂，呈暗褐色，表面出现灰色霉层，其他部位症状较少，浅灰褐色，其他部位有有相似症状。温度大时可以用速克灵烟剂熏，温度不大可选喷开尔加克菌星粉剂混合物，7天1次，连喷2~3次。
疫病引起的烂果。多数先从蒂部染病，呈水泽状灰绿色斑，后迅速边褐软腐。潮湿天气，表面长出稀疏的白色霉层，病果干缩不脱落。其他部位如茎叉枝叶上，常有水泽状褐斑。可喷64%杀毒矾与55%瑞毒霉混合液（50千克水中，两药个加100克），或58%甲霜灵锰锌400倍液，或47%加瑞农800倍液，7天1次，连喷2~3次。
棉腐病引起的烂果。果实受害腐烂，湿度大时，上生大量白霉。可喷50%DT杀菌剂500倍液或14%络氨铜水剂300倍液，7天1次，连喷2~3次。
日灼病引起的烂果。高温天气，果实向阳部分，受阳光直晒，使果皮褪色变硬，产生灰白色革质状斑，易被其他菌腐生，出现黑霉或腐烂。应及时浇水，改善田间小气候，均衡供水，叫少该病发生。
1、疫病引起的烂果
疫病从苗期到结果期一生都有发生，是造成落花、落叶、落果的主要病害，烂果多数先从蒂部染病、呈水渍状灰绿斑后迅速变褐软腐。湿度大时，表面长出稀疏的白色霉层，果实干缩不脱落；其他部位如茎杈枝叶上，常有水渍状褐斑。
2、灰霉病和菌核病引起的烂果
灰霉病于初花幼果期危害多，以门椒、对椒发病重，在幼果顶部或蒂部出现褐色水渍状病斑，后凹陷腐烂，呈暗褐色，表面出现灰色霉层，其他部位症状较少。菌核病由果柄发展到全果，呈水渍状腐烂、浅灰褐色，其他部位也有类似的症状。
3、软腐病引起的烂果
初呈水渍状暗绿斑，后全果软腐，具恶臭，果皮变白、干缩后脱落或挂在枝上，其他部位少有症状，整个结果期都有发生。
4、炭疽病引起的烂果
初呈水渍状黄褐色圆斑，常密生小黑点。叶片染病，初为水渍状褪绿斑点，后变为边缘褐色，中央浅灰色的小斑。
5、绵腐病引起的烂果
果实受害腐烂，温度大时，病部生出大量白雾。