小麦病毒病的防治方法有以下三种：
1、选育和利用抗病品种，虽然目前没有黄矮病和丛矮病免疫品种，但品种之间抗病毒病有差异。另一方面，病毒不易检测，虫传范围又广，采取其它应急的防治措施比较困难。因此在综合防治中，选用抗耐病品种是一项基本措施尤为重要。
2、农业栽培措施：田间杂草，许多杂草是飞虱、叶弹、蚜虫的宿主，也是小麦病毒病的毒源，田边、渠旁杂草也有防病效果。另外要及时灌水、平衡施肥等。
3、化学防治：由于苗期和秋季侵染所造成的损失远大于春季侵染，应注意拌种措施和喷药措施相结合。（1）灭虫防治：吡哆啉、灭蚜松播前拌种；生长期间喷雾防治，主要有抗蚜威，锐劲特和菊酯类；（2）喷吗啉胍，增抗剂、病毒啉等新型药剂。
（1）鉴定选育抗、耐病品种一些农家品种有较好的抗耐病性，因地制宜地选择近年选育出的抗耐病品种。
（2）治蚜防病及时防治蚜虫是预防黄矮病流行的有效措施。拌种甲拌磷原液100～150g加3～4kg水拌麦种50kg，也可用种子量0.5%灭蚜松或0.3%乐果乳剂拌种，逐步取代甲拌磷。喷药用40%乐果乳油1000～1500倍液或50%灭蚜松乳油1000～1500倍液、2.5%功夫菊酯或敌杀死、氯氰菊酯乳油2000～4000倍液、50%对硫磷乳油2000～3000倍液。也可喷1%对硫磷粉或1.5%乐果粉每667m^2/1.5kg，抗蚜威每667m^2/4～6g。毒土法40%乐果乳剂50g对水1kg，拌细土15kg撒在麦苗基叶上，可减少越冬虫源。
（3）在发病初期可用生物农药2%条缩康（武夷菌素）每亩50毫升防治。
（4）加强栽培管理，及时消灭田间及附近杂草。冬麦区适期迟播，春麦区适当早播，确定合理密度，加强肥水管理，提高植株抗病力。
（5）冬小麦采用地膜覆盖，防病效果明显。
（1）小麦品种间对病毒的抗性差异是明显的，不同程度耐受病毒的品种也较多。另一方面，病毒不易检测，虫传范围又广，采取其它应急的防治措施比较困难。因此在综合防治中，选用抗耐病品种是一项基本措施。对土壤传播的几种病毒病，选种抗耐病品种尤为重要。
（2）种子包衣：对黄矮病、丛矮病、红矮病等虫传病毒病，只要控制其传播途径，就能有效地防治病害，每亩用格猛或越众30ml拌种可有效防治小麦蚜虫。
（3）防治传毒昆虫可选择：在小麦出苗后和拔节期每亩可以用功瑞30ml进行叶面喷雾。
（4）发病前期可用小叶灵40g+好鲜收15ml进行叶面喷雾，间隔7天连续2-3次。
（5）农业防治措施，如改良轮作制度、作物合理布局、调节播种期和其它栽培管理措施等都是重要的防治手段。小麦黄矮病发生区要减少糜子种植面积或集中种植，注意治蚜。因为糜子是麦蚜与小麦黄矮病毒越夏的重要寄主。对上述几种病毒病，适当推迟播种期均能减少发病数量。许多杂草是飞虱、叶弹、蚜虫的宿主，也是小麦病毒病的毒源，田边、渠旁杂草也有防病效果。