水稻三大主要病害是：稻瘟病、白叶枯病、纹枯病。其它重要病害有稻曲病、恶苗病、霜霉病等。病害流行暴发的根本原因是：优质感病品种比重增大，病菌生理小种增多，耕作栽培制度变化等向着有利于病害发生和危害的方向发展。
外源性害虫即远距离迁飞性害虫，如褐稻虱、白背稻虱、稻纵卷叶螟、粘虫等。本世纪迁飞性稻飞虱发生相对偏轻，但不能麻痹，加强监控，防止回升；稻纵卷叶螟持续猖獗，特别是第4代（8月下旬~9月上旬）大发生，对粳稻穗期造成严重为害。内源性害虫即本地虫源、本地繁殖、本地为害，如三化螟、二化螟、大螟、灰飞虱、稻蓟马等。本世纪螟虫兴风作浪，灰飞虱小虫闹大灾。
一、采用佳多频振灯诱杀二化螟的成虫，每盏灯控制面积30亩。吊挂高度为1.5~2.0米，略高于水稻，放置在水稻田的四周，于二化螟和稻水象甲越冬场所附近。开灯时间一般从6月中旬开始，至7月末结束。使用期间，每天天黑即开灯诱虫。天亮即关灯。视诱杀虫量多少定期清理灯箱并选择合适地点进行残虫体处理，底点距作物高度0.5米。可以有效地防治二化螟、稻水象甲等。采用性诱剂诱杀二化螟成虫，用诱捕器口径以24厘米为佳，不同颜色水盆诱捕器的诱集效果为绿>红>蓝，性诱剂离水面高度以0.5~1厘米，诱盆高于水稻20厘米为宜。每公顷设20个诱杀盆。6月末到7月初开始检查田间二化螟成虫及成虫产卵、二化螟孵化高峰情况，在二化螟孵化高峰2~3天，开始药剂防治，确定适宜施药时间。采用Bt杀虫剂防治。由于Bt杀虫剂是生物药剂，药效发挥较慢，施药时间应比化学杀虫剂要提前2~3天，以卵孵化盛期至1龄幼虫期施用效果。100亿孢子/克Bt粉剂，每亩用50克兑水稀释2000倍常规喷雾防治。
二、每亩用100亿孢子/克Bt粉剂50克加18%杀虫双水剂100毫升常规喷雾防治。
药剂防治：18%杀虫双水剂每亩250毫升，兑水40~50公斤喷施。80%杀虫单粉剂每亩35~50克，兑水40~50公斤喷雾。
水稻稻水象甲：泡田灌水时，使土内越冬成虫和幼虫浮于水面，捞出销毁，或者用甜物诱杀。在成虫发生期，用糖醋酒液草诱捕成虫3~―4天，早晚将捕到的成虫收集销毁，在我省一般于5月下旬到6月中旬部分成虫爬到杂草植株上或玉米田后施用50%稻乐油，每亩用500毫升兑水40~50公斤，或90%晶体敌百虫600倍液喷雾，压低发生基数。另外，秧田是越冬代成虫集中的场所，易于防治，可减少成虫由秧苗带入本田。防治适期为插秧前3~5天。本田越冬代成虫防治：插秧后 5―7天，田间虫量即达高峰，是防治时期。本田新一代成虫防治：7月中旬至8月中旬是新一代成虫危害盛期，此时虽然对水稻危害不重，但直接影响下年的发生程度，应及时防治，把新一代成虫消灭在迁移越冬场所之前。
药剂防治幼虫：每亩用25%阿克泰水分散粒剂2~4克，兑水50公斤对稻苗喷雾即可。此药在防治稻水象甲的同时，可防治潜叶蝇、二化螟、负泥虫、稻蝗等水田常见害虫。
三、稻鸭共育技术： 采用大棚旱育苗或钵盘育苗，为了方便鸭子在田间活动采用稀植30厘米×20厘米的株行距，每穴插4―5苗，因株行距加大，每穴适当增加1~2苗，每亩可放养12只鸭子，3只母鸭，9只公鸭。可有效防治虫害和草害。
四、注意事项： 做好病虫害预测，避免错过防治时期，做到及时防治，提高防治效果。
早、中、晚稻的根本区别在于对光照反应的不同。早、中稻对光照反应不敏感，在全年各个季节种植都能正常成熟，晚稻对短日照很敏感，严格要求在短日照条件下才能通过光照阶段，抽穗结实。晚稻和野生稻很相似，是由野生稻直接演变形成的基本型，早、中稻是由晚稻在不同温光条件下分化形成的变异型。北方稻区的水稻属早稻或中稻。
稻恶苗病
又称白秆病，系水稻地上部的一种真菌病害。病原菌是子囊菌亚门的藤仓赤霉菌。无性态为半知菌亚门的串珠镰孢。从秧苗期至抽穗期均可发病。病株徒长，瘦弱，黄化，通常比健株高3～10厘米，极易识别。病株基部节上常有倒生的气生根，并有粉红霉层。病菌发育适温25℃左右，种子带菌。选用无病种子或播种前用药剂浸种是防治的关键措施。
稻纹枯病
对发病稻田，应掌握孕穗期病株率达30%～4%时施药。药液要喷在稻株中、下部。采用泼浇法，田里应保持3～5厘米浇水层。施用井岗霉素时，在雨后晴天进行，或在施药后两小时内不下大雨时进行。亩用5%井岗霉素水剂100～150毫升，或井岗霉素高浓度粉剂25克，任选一种，对水100千克常规喷雾，或对水400千克泼浇。
水稻螟虫
重点要抓好2代2化螟和部分地区的2代3化螟的防治，并以水稻处于孕穗到齐穗以前的稻田为重点。亩用5%杀虫双大粒剂1～1.5千克撒施，也可亩用25%杀虫双水剂150～200毫升，或25%杀虫双水剂100毫升加BT乳剂100毫升，任选一种，兑水60～75千克常规喷雾，或兑水5～7.5千克低量喷雾。
稻飞虱
应掌握小若虫高峰期，每百丛虫量达1500头以上时施药防治。用药时应注意先从田的四周开始，由外向内，实行围歼。喷药要均匀周到，注意把药液喷在稻株中、下部。使用扑虱灵可湿性粉剂20～25克，或25%优乐得可湿性粉剂20～25克，或20%叶蝉散乳油150毫升，任选一种，兑水75～100千克常规喷雾，或兑水5～7.5千克低量喷雾。
稻苞虫
以迟中稻田为重点，掌握低龄幼虫盛期，每百丛水稻有虫10～20头时施药。亩用90%晶体敌百虫75～100克，或50%杀螟松乳油100～250毫升，或BT乳剂150～200毫升，任选一种，兑水75～100千克常规喷雾，或兑水5～7.5千克低量喷雾。
稻纵卷叶螟
重点防治主害代。在低龄幼虫期，每百丛水稻有初卷小虫苞15～20个，或穗期每百丛有虫20头时施药。亩用25%杀虫双水剂150～200毫升，或50%杀螟松乳油72毫升，任选一种，兑水60～72千克常规喷雾，或兑水5～7.5千克低量喷雾。施药时间以傍晚为宜。
大力推广穗期使用粉锈宁新技术。在水稻孕穗期，每亩用15%粉锈宁可湿性粉剂50～100克，对水常规喷雾或低量喷雾，可有效地防止杂交稻早衰，还可兼治稻纹枯病、稻曲病、稻粒黑粉病等多种穗期病害。
稻蝽蟓
为害状：用口器刺吸茎杆汁液、谷粒汁液，造成植株枯黄或秕谷，减产甚至失收。主要为害早晚稻早抽穗或迟抽穗的稻田。
药剂防治：在水稻抽穗期进行药剂防治，早晚露水未干时喷药效果。每亩可选用：⑴、80%敌敌畏乳油75～100毫升。⑵、40%毒死蜱乳油50～75毫升。⑶、20%三唑磷乳油100毫升。兑水50公斤喷雾。