甜青椒是目前贮藏量和运输量较大、经济效益较高的蔬菜种类之一。为了更好的贮藏好甜青椒，以下的几点需要注意一下：
1、甜椒极易失水萎蔫 由于甜椒果实内部是空腔的，所以失水后变软、皱缩等现象比番茄等实心的果实更加明显，故无论是在贮藏还是运输过程中，都不可不加包装长期裸露。
2、甜椒对低温很敏感 温度低于8摄氏度贮藏时会发生冷害。受了冷害的甜椒萼片和种子变成褐色，果面出现凹陷小斑点、随之受害部位被病菌侵染引起腐烂。冷害也有可能在秋延甜椒采收前即发生。这种在田间就受了冷害的甜椒不可用于贮藏，否则会造成很大损失。
3、甜椒对二氧化碳气体十分敏感 在贮藏中由于呼呼作用甜椒不断地释放出二氧化碳，其浓度超过2%往往就会发生二氧化碳伤害，其结构是腐烂率大大增加。为了防止二氧化碳伤害，应注意垛藏时不要堆积太紧，垛也不要过大。
4、采摘时要连果柄摘下，用剪刀带果柄一起剪下，轻轻放入袋或垫有纸或席片的筐里，采收的甜青椒放在普通 房间或库内，经过1-2天后，再选果贮藏。