生物肥料是指一类含有大量活的微生物的特殊肥料。这类肥料施入土壤中，大量活的微生物在适宜条件下能够积极活动，施用技巧如下：
一是有机肥与无机肥相结合
不少菜农无论冲施还是追施，均以化肥为主。虽然有些冲施肥含有腐殖酸，但无机肥多以硝铵、尿素等氮肥为主，短期内蔬菜长势好，但缺乏长期效应，应与有机肥结合施肥。
二是追施肥与冲施肥相结合
选用肥料以多元复合肥为主，采取追施与冲施相结合的办法，一方面解决表层根需肥问题，另一方面追肥能活化土层，增加根系，缓解肥效。
三是大水与小水冲施相结合
不少菜农无论苗期、结果期均以大水冲施肥，使得肥水过大，引起苗病、烂根、沤根。水小容易干枯，无论生物肥、有机肥、化肥都要看苗用肥，合理用量。
四是生物肥与化肥相结合
“百事康”微生物有机肥富含十几种有益菌，具有活化土壤，调节养分的功效，与无机肥配合施用，能解除肥害，增加土壤有机质，促进根系发育。
生物肥料的种类很多，现在推广应用的主要有根瘤菌类肥料、固氮菌类肥料、解磷解钾菌类肥料、抗生菌类肥料和类肥料等等。