黄瓜绿斑驳花叶病毒，是一种新传入危险性有害生物。主要危害西瓜、黄瓜、甜瓜、葫芦、南瓜等葫芦科作物，是一种通过种子远距离传播的病毒性病害。因此，我们要加大防治。
1、种子处理：不能随便引种，更不能从病区引种和病地采种，严格遵守检疫制度。无论是西瓜或葫芦的种子都必须进行种子处理（在70℃下干热处理3日或3～10％亚磷酸三钠浸种10分钟）。
2、农业防治：农事操作应小心从事，注意减少植株碰撞，中耕时减少伤根，浇水要适时适量，防止土壤过干。种子萌芽出苗后，发现花叶或畸形病株，立即拔除，集中销毁，不能随便乱放丢弃。无论是砧木或接穗，都要选择驳、花叶的健株，嫁接时要注意，避免接触传染。病地一定要实行轮作倒茬。加强田间管 理，增施肥料，增强抵抗力，促进植株生长，尽量减轻损失。
3、土壤处理：利用溴甲烷40～80g/m2进行土壤，具有较好的效果。
黄瓜绿斑驳花叶病毒可以通过种子带毒，土壤传染的可能性也很大。另外，嫁接、田间作业也容易造成接触侵染。因此，对黄瓜绿斑驳花叶病毒的防控，根本的要使用无侵染的种苗，在农事操作中尽量避免病毒经器械等传播，加强栽培管理，及时拔除初侵染病株，销毁病株残体，才能有效防治黄瓜绿斑驳花叶病毒。