由于冬季大葱种株越冬时呼吸消耗养分，因此制种产量低一般亩产25公斤左右，可作为原种使用。做好大葱制种田的管理是很关键的。
一、抽薹期管理 制种田于3月底4月初浇水，结合浇水每亩追施三元复合肥40~50公斤。适墒覆背防倒伏，覆背时土壤不能太湿，以防引起烂茎。田间见干见湿。
二、开花结籽期管理 此期需水较多，应保持土壤湿润。种株生长弱的地块，结合浇水每亩冲施尿素15~20公斤。同时做好辅助授粉工作，人工拖棉布在花球顶端轻轻走动帮助授粉，连片制种田可购买蜜蜂辅助授粉，为高产奠定基础。
三、病虫害防治 制种田很容易发生霜霉病、紫斑病，生产中以防为主，抽薹后每隔10~15天交替喷施600倍50%百菌清和70%代森锰锌。发生蚜虫和金龟子危害时用1000倍吡虫啉喷雾防治。
大葱是异花授粉作物，如果不注意选留种，就会造成种性退化，丧失其优良性状。因此，按科学的方法选留种是保持大葱优良性状的重要手段。