农户购买使用农药后，一般都会有剩余。为起见，剩余农药存放在木箱内，外贴标签加锁；不可与粮食、
蔬菜、饲料同放，要远离易燃易爆物，如鞭炮、火药等。乐果、敌敌畏等农药极易挥发、污染空气，存贮时要拧紧瓶盖、密封，并尽量避免阳光照射，否则会变质、失效。两种不同的农药不可混装在同一个瓶、袋内，以免产生化学反应。碱性、酸性、中性农药存放时，相互间应保持一定距离，不然也会导致药效降低、变质或失效。
农药标签不可丢失，因水湿等原因造成标签字迹不清时，要人工抄写，贴在外包装上。对已失效或剩余的极少量农药要深埋，不可随便倾倒在池塘、河流里。农药原包装瓶、袋不能装食用品及家庭日常用品。
农药应存放在阴凉、干燥、通风的地方，环境相对湿度保持在75%以下，温度不超过35℃，但不低于1℃，因为温度过低会使液体农药结冰、冻裂。天冷时，可用稻草、稻壳等覆盖保温。