在选用种肥时，必须注意选用对种子或幼芽副作用小的性肥料。在现有氮素化肥中，硫酸铵的吸湿性小，易溶解，适量施用对种子萌发和幼苗生长无不良影响，适合做小麦种肥。
尿素含氮量高，但含缩二脲，影响种子萌发和幼苗生长，故一般不宜与
种子混合播种。如需要用尿素做种肥时，必须选用优质尿素，用量不能过大，每亩2～3公斤，采用条施，先施种肥后播种，尽量避免种子与肥料接触。
过磷酸钙易溶解，但在土壤中移动性小，其范围一般在1～3厘米，大多集中在施肥点0.5厘米范围内。含有游离酸，具有腐蚀性，易吸湿结块，施入土壤后，易被土壤化学固定而降低磷的有效性。选用做种肥时，必须选优质特级品，每亩10～15公斤，不能接触种子。也可用10%的草木灰与过磷酸钙混合中和酸性。方法是与优质过筛的农家肥混合施用。
钙镁磷肥，不潮解，不结块，对种子没有腐蚀性，物理性较好，施入土壤后，移动性小，不易流失，易被土壤溶液中的酸和作物根系分泌的酸逐渐分解，为作物吸收利用，宜做小麦种肥，每亩5～10公斤，可以拌种施用。
硫酸钾，吸湿性小，易溶于水，不易结块，物理性好，施用方便。在缺钾的土壤上，可用硫酸钾做种肥。硫酸钾施入土壤后，钾离子可被作物直接吸收利用，也可被土壤胶体吸附。每亩用量为1.5～2.5公斤。要注意，硫酸钾的肥分含量高，不能与种子接触，以免烧幼苗。一定要控制好用量，肥料与种子相距 3～5厘米为佳。
腐熟的厩肥、牛羊粪、猪粪、鸡粪、兔粪等，经压碎过筛后，均可以做种肥施用。由于农家肥含有较多的有机质，能改良土壤，培肥地力，可与小麦种子拌种施用。此外，用磷酸二氢钾或肥料进行拌种，或用微肥做小麦种肥，均有增产效果。