绿色蔬菜和无公害蔬菜允许适当使用化学
肥料，但提倡化肥应和有机肥料配合使用，以改良土壤、提高肥力、减少污染、降低成本。绿色蔬菜栽培常用的肥料可分为
有机肥料、生物肥料和化学肥料。有机蔬菜依规定禁止使用人工合成的化学肥料，主张使用有机肥料和生物肥料。
生产绿色环保型蔬菜，为减少对环境和产品的污染，施肥时应以基肥为主，追肥为辅；施肥种类应以有机肥为主，辅以其他肥料，绿色蔬菜及无公害蔬菜限量使用人工合成的化肥，化肥只是弥补有机肥料中营养不足的一部分；使用人工合成的化肥也应以复合肥料为主，单元素的化肥为辅。由于
生物肥料和化学肥料均属商品肥料、各种产品均有介绍，这里不再赘述。
有机肥料是含有较多的有机物，来源于动植物残体及人、畜粪便等废弃物的肥料的统称，它是蔬菜的主要肥源。有机肥料中含有丰富的有机质和各种营养元素，如纤维素、半纤维素、脂肪、蛋白质、氨基酸、及腐殖酸等。它具有改良土壤、培肥地力的作用。有机肥中的腐殖质能使土壤形成团粒结构，改良土壤的通气性，提高土壤的保水、保肥能力。施用有机肥料能促使土壤中有益微生物大量繁殖，将土壤中难以利用的磷、钾和微量元素转化为作物可以利用的有效养分。还能拮抗土壤中有害微生物的活动，提高作物的抗性。但有机肥又具有脏、臭、不卫生、养分含量低、肥效慢、体积大、分量重、运输和使用不方便等缺点。