玉米粗缩病有发生的时候，一定要及时的选用农药来防治。
1、选育种植抗病品种。一般硬粒型比马齿形的单交种抗病，自交系高抗的有冀8、综3、中黄64、GY237、P12、P20、BS110、138、6513、E综1214.
2、农业防治措施：压缩麦田套种玉米的面积，做好小麦田病毒病的防治工作，减少毒源向玉米上转移。
3、播种后彻底田间、地头禾本科杂草，结合间苗、定苗拔除病株，降低毒源。
4、合理施肥、灌溉，加强田间管理和中耕除草，提高植株抗病能力。
5、药剂防治：用内吸杀虫剂拌种，在玉米出苗前后用40%乐果乳油或敌敌畏乳剂1500倍液喷洒玉米田和地埂田头1~2次；30%乙酰甲胺磷乳油 80~150毫升，对水60~75升喷雾；或每公顷用80%敌敌畏乳油2250~3750毫升，加水5~10倍，分次倒入195~225千克细沙（或细土），随拌随用，均匀撒入田间。
6、玉米苗期喷施菌毒清、病毒A或植物调节剂如赤霉素等。