西葫芦烂茎是发生病害了，那么我们就要寻找其发生病害的关键，首先蔓枯病。病菌主要从西葫芦的茎节处侵入，病部初呈暗褐色，后逐渐变成黑色，病斑处易裂口，流出白色胶状物，后期病茎干缩，纵裂似乱麻状。二是软腐病。多从西葫芦的根颈部染病，茎蔓先呈水渍状，后逐渐变软，病部凹陷，内部组织腐烂，形成灰褐色黏稠状物，有恶臭味。
针对这两种病害造成的西葫芦烂茎，首先要避免棚内高温高湿。西葫芦蔓枯病及性软腐病在高温高湿环境下发病重。棚室管理应注意加强通风降温，白天棚温控制在23℃左右，夜间控制在13℃左右。其次要保护好植株伤口。避免在棚内湿度大时疏叶、摘瓜及打杈，并使用琥胶肥酸铜等铜制剂涂抹伤口。再次要做好药剂防治。对蔓枯病，可以用25%咪鲜胺乳油1500倍液或阿米妙收325克/升苯甲·嘧菌酯悬浮剂1000倍液喷雾防治。对性软腐病，可以用72%农用硫酸链霉素可溶性粉剂（1500倍液）加30％琥胶肥酸铜可湿性粉剂（500倍液）喷雾防治，每隔5～7天一次，连续防治2～3次。