微耕机在不同的环境中使用方法也不一样，大棚内空间有限，在进行大棚地块的耕作时，宜选用操作灵便的微耕机。而对于微耕机的操作要做到以下五点：
一是菜农朋友必须熟练掌握操作技能，熟知操作的常识，切不可盲目驾驶。
二是进行大棚地块耕作前，菜农朋友应仔细检查微耕机的燃油、机油状况，若油量少，应及时添加。此外，还要检查微耕机各部件的损失情况和紧固件的松紧度，若有问题，需及时排查。同时，建议菜农朋友提前观察耕作地块的现场情况，做到心中有数。
三是进行大棚地块耕作时，不要有妨碍操的动作，如乱挂档等。同时，严禁酒后上机操作，以免发生危险。
四是在耕作过程中，若要进行倒退移动时，必须挂低档，踩小油门，在控制好离合器的同时，要确保自己身后具有足够的移动空间，两腿与旋耕刀要保持一定的距离，起步时要缓慢，以防机具伤人。
五是耕作完毕后，在转移地块时，应将微耕机旋耕刀的动力切断，谨防意外伤人。