土壤酸碱性程度不一样，其该选用的
肥料也不一样。
适合不同农作物生长的高产土壤，一般要求呈中性、微酸性或微碱性反应，pH值多在6-8之间。因为在酸性土壤中，可溶性磷易与铁、铝化合，形成磷酸铁、铝而降低有效性。土壤中的交换性钾、钙、镁等易被氢离子置换出来，一旦遇到雨水，就会流失掉。酸性土壤也往往缺硫和钼。对酸性土壤应增施石灰，以中和土壤酸度，铝的毒害，提高养分的有效性。同时注意增施有机肥料，通过有机肥料的缓冲作用，减轻酸性对土壤和作物的影响。化学肥料宜选用氨水、碳铵、钙镁
磷肥等碱性肥料。
在碱性土壤中，尤其是石灰性土壤，可溶性磷易与钙结合，生成难溶性磷钙盐类，会降低磷的有效性。还有在石灰性土壤中，许多微量元素如硼、锰、钼、锌、铁的有效性会大大降低，致作物常常感到这些营养元素不足，并发生各种生理性病害。因此，应故要重视并有针对性选用上述微肥作基肥或追施。基施时可将微肥同有机肥料一起进行腐沤一定时间，以增加微肥的有效性。在微肥不足的生长季节发生缺素症时，应及时用相应的有机螯合肥进行叶面喷施，以减轻生理病害的危害程度。
在石灰性土壤上施用过磷酸钙、硫酸铵、氯化铵等酸性和生理酸性肥料较好，可以降低和减轻土壤碱性的危害。还可以适当施用石膏、磷石膏、硫酸亚铁、硫磺粉、酸性风化煤等，但不要施用碱性肥料，如氨水、碳酸氢铵、草木灰等，特别禁忌施用强碱性肥料石灰。另外，在盐碱土上不宜施用氯化铵肥料，并注意铵态氮肥要深施覆土，防止氨的挥发损失。磷肥可集中施用或与厩肥、堆肥混合使用，以减少磷的固定，提高肥料利用率。