辣椒疫病的发生对辣椒的生长非常不利，所以我们一定要选择合适的方法和技巧来进行。
（1）农业防治：①选用优质、高产、抗病品种。②避免与花生、茄科类作物连作。可与十字花科等作物轮作，是水旱轮作。③前茬收获后及时清理残枝落叶，集中烧毁或深埋，耕翻土地，以减少病原基数。菜椒生长期和收获后及时田间病株和病残体，严禁将病株和病残体随意堆放，应集中烧毁。并在田间喷施护树将军。
（2）物理防治：育苗前，将
种子用55℃温水浸泡30分钟。
（3）药剂防治：①发病初期用50%氟吗锰锌(施德益)900克/公顷，或68%精甲霜·锰锌(金雷)水分散粒剂1500～1800克/公顷+新高脂膜对水喷雾。每隔7～10天喷～次。