香菇烂棒的原因有下面几点：
一、香菇烂棒发生的时间，从菌棒发菌到一定程度后便可发生，一般是前期发生较轻，中后期发生较重，严重时造成菌棒腐烂绝收。
二、香菇烂棒的原因
1、培养料配比不合理，拌料不均匀，尿素、过磷酸钙、石膏、石灰等添加物超量。
2、培养室长时间通气不良，二氧化碳浓度高，氧气不足，致使菌丝回菌，影响菌丝生长发育。
3、培养室长时间温度过高，超出了香菇适宜生长温度范围，刺孔后堆温大幅度升高引起“烧菌”，造成菌丝生长脆弱甚至死亡。
4、阳光直射菌棒，强烈的紫外线菌袋内的菌丝，甚至菌丝被杀死，菌棒局部出现黄水，菌棒上淤积黄水过多，影响通气，极易造成杂菌感染。
5、出菇生产环境空气湿度过高，给菌棒补水时水温过高，补水过多，高温闷热天气通风不良等原因导致菌棒烂棒。
6、采菇后没有及时清理菇根、对于没有完全转色好的菌棒和采菇人员技术不熟练，采菇时带下大块培养料造成菌丝受伤等原因，喷水后极易滋生霉菌导致菌棒烂棒。
香菇烂棒轻者造成减产，重者导致绝产，望菇农根据实际情况在生产中加强管理。