番茄根结线虫发生后巧施肥料可解决，具体的做法如下：
1.清洁田园，收净带有根结线虫的病原体，集中深埋或烧毁。
2.重病地可与耐线虫的韭菜、葱、辣椒等进行2～3年轮作。水旱轮作效果更好。
3.施用腐熟的有机肥，特别要增加微生物菌肥的使用，一般每亩集中使用（沟施或穴施）微生物菌剂30～40公斤，可减少根结线虫的危害。
4.进行防治。通过我们在寿光、聊城、济阳多地试验，番茄在下基肥之前，每亩选用阿维菌素有机肥或克线蛆菌有机肥320～480公斤作基肥，在番茄盛果期，再冲施2～3次，每次每亩冲施40～80公斤，对防治番茄根结线虫效果十分明显。在用化学农药防治根结线虫时，不要使用剧毒和高残留的农药。必要时可选用阿维菌素或1.8%爱福丁1500～3000倍液灌根。