种子和秧苗上水分的重要性：
水分适宜时幼苗生长健壮；水分缺乏时，幼苗处于干渴状态，使叶温上升，会抑制小苗的生长发育；长时间缺水幼苗生长停止，衰老，成为小老苗。在实践中，一串红在籽苗期严重缺水就容易成为小老苗，观赏辣椒也有相似属性。水分多，地温低，病害容易蔓延，幼苗发育不良；温度高，水分多，幼苗容易徒长。
育苗时，水的供给量一般不成问题，然而如果育苗天数太长，秧苗长大，后期温度难于控制时，为防止徒长就要采用控水的方法。在育苗的各个阶段，都有因营养面积太小，为防止争光徒长采取较长时间控水的情况，但这样会导致秧苗老化，这在生产中屡见不鲜。含水量的多少直接影响土壤空气的含量、土壤温度和肥料的分解。水分过多，根系缺氧，导致吸收障碍。
空气湿度直接影响着水分的蒸发和秧苗的蒸腾。塑料薄膜温室空气湿度容易偏高，对秧苗的蒸腾作用抑制较重，不利秧苗生长，应适当放风降湿。温室或拱棚若突然放大风，在露地空气湿度较低时，会使得秧苗蒸腾太强太快，从而缺水萎蔫，缺水严重的叶片边缘坏死，以至于不能恢复。