柠檬如修剪不当，往往只开花、不结果或少结果，甚至不开花。要让柠檬年年开花、结果，修剪环节必须精心，才能达到果实累累的目的。
幼树和初结果树修剪的主要目的是培养树冠骨架，以便更快更好地扩大树冠。幼树修剪在冬季适宜，在生长季应进行摘心和必要的短截，尽可能地保留枝叶和辅养枝。修剪的要点如下：
1.长梢摘心
幼树宜抽长梢，各季枝梢抽生后，除对长梢保留8～10片摘心外，其余均要作嫩梢摘心。留长度20～25厘米为宜，充实健壮树冠，早分枝、多分枝，从而尽快扩大树冠。
2.拉枝、辅养枝培育
对长势旺盛的直立枝梢，宜采用拉、撑的方法。较强枝下拉，撑大分枝解角40°～50°，对幼树采取拉、撑措施，可使幼树提早1～2年结果。
通常在树冠内抽生的小枝，只要不是徒长枝和过密枝，一般都应保留。这些小枝常常是幼树的良好结果母枝。
3.抹芽放梢、及时抹除徒长枝
对幼树可在夏季进行抹芽放梢，即放一次秋梢，以利于尽快扩大树冠。徒长枝扰乱树形，浪费养分，应及时抹除。
4.控夏梢
生长强旺的幼树，抽发的强旺梢较多。由于长势强旺的夏梢不易抽生秋梢，又不利于花芽分化，因此在5月至6月，使用“促花王2号”，控夏梢抽发，集中养分供应，壮果、促花。
5.疏花疏蕾
对幼树在计划产果前的弱树出现的蕾和果，应及时疏除，以促进树体营养生产，尽快形成结果的树冠而投产。
6.修剪口及时封闭
修剪时造成的伤口常常是病虫侵入的入口，要及时用“愈伤防腐膜”封闭，防干裂、病虫为害，雨水污染。
柠檬修剪是对树体实施枝梢处理技术，通过修剪人为调节树体生长和结果的关系，发挥树体结果的潜力，达到丰产稳产和优质的目的。