农药选用尽可能选用生物制剂农药和土农药。同时可以选择、低毒、低残留的化学农药，如敌敌畏、敌百虫、菊酯类、多菌灵、甲基硫菌灵、百菌清、粉锈宁、波尔多液和石硫合剂等。严禁使用高毒、高残留农药。在果树生产中严禁使用的高毒农药有：甲胺磷、呋喃丹、1605、3911、氧化乐果、杀虫脒、杀扑鳞、六六六、三氯杀螨醇、甲基异柳磷、久效磷、灭多威及有机汞制剂等。
现介绍几种低毒的生物制剂农药。
阿维菌素：是当前无公害果品生产中适宜的生物制剂农药。对抗性害虫、害螨有很强的药效。有强劲的触杀、胃毒作用，药效迅速、防治彻底。可有效防治蚜虫类、红蜘蛛类、食心虫类、梨木虱、刺蛾类、金龟子类及其它食叶害虫。吡虫啉新一代尼古丁杀虫剂．是替代氧化乐果和久效磷的强内吸性无公害杀虫剂，可有效防治各种蚜虫、蚧壳虫、梨木虱、卷叶蛾等害虫。
灭幼脲Ⅲ号：是一种仿生制剂农药，以胃毒作用为主，兼有触杀作用。耐雨水冲刷，持效期达20天，对天敌。可防治危害果树的鳞翅目食叶害虫的幼虫。
苦参碱：苦参碱是一种广谱性植物杀虫剂，对人畜低毒，具有触杀和胃毒作用，可有效防治鳞翅目幼虫和红蜘蛛类。
螨死净：对若螨、卵有，对天敌无害，具有渗透性强、药效期长的优点，是替代三氯杀螨醇、水胺硫磷等杀螨剂的理想药剂。
绿色威雷Ⅱ号：是触破式微胶囊剂，有效成分为阿维菌素，可有效防治天牛类和吉丁虫类的成虫。
多氧霉素(又名宝丽安)：属农用类剂，具良好的内吸性，是保护和剂，可预防和防治轮纹病、炭疽病、落叶病、白腐病等多种病害，是替代多菌灵、甲基硫菌灵的理想剂。
果树枝干病害的防治可选用腐克、福美胂等
剂。果树叶部锈病和白粉病可选用剂粉锈宁防治。
农用链霉素是防治性病害的剂，可用来防治桃、杏性穿孔病。