黄萎病菌生存力强，传播快、危害大、防治难。要坚持以选用抗病品种为基础，以加强栽培管理为中心，以药剂防治为保证的综合防治措施，才能有效防治茄子黄萎病。
1.选用抗病品种：凡叶片长圆形或尖形，叶缘有缺刻，叶面茸毛多，叶色浓绿或紫色的品种较抗病，如郭庄长茄等。
2.栽培措施防治：（1）轮作倒茬。和茄科作物实行五年轮作，不要和茄科作物邻作。选用葱蒜茬和大田茬栽茄子。（2）科学施肥。亩施腐熟农肥3－4立方米，磷酸二铵15－20公斤，尿素10公斤左右，钾肥10－15公斤，切忌偏施氮肥，忌施生粪，以免烧根。（3）合理密植。密植植株封垄早，减轻地裂伤根。栽植密度以60×30厘米为宜。（4）提高定植质量。茄子定植时要坚持“四不”：在10厘米地温稳定在15℃以上，选择晴暖天气定植，做到定植不过早；用营养钵护根育苗，做到定植不伤根；以早晚栽苗为好。中午烈日下不栽苗；栽苗以埋平土坨为宜。不可过深。栽苗时要覆盖地膜，再加扣上小拱棚，做到双膜覆盖。（5）巧管水肥。茄子生长前期地温偏低，尽量少浇水，需要浇水时要选择晴暖天气浇水，防止阴冷天气浇水，以免引起黄萎病暴发。7月中旬至9月中旬高温季节，要小水勤浇，保持地面湿润，使土壤不干不裂，减小地裂伤根，控制发病。在门茄现蕾期，用奇农素10克＋赤霉素0.25克＋硼肥 100克＋尿素50克加水15公斤，10天喷一次，直到停止开花时止，可使花果成倍增加，增强抗病力。
药剂防治。防治处方：（1）奇农素10克＋的确灵杀线剂5克，加水15公斤，在发病前或发病初期浇灌茎基部，每株灌药液 150－200克，5－7天灌1次，连灌2次。（2）奇农素10克＋硫酸铜25克，加水15公斤喷湿全株。用上述混合液中的一种，在发病初期灌根或喷施，5－7天喷1次，连续2－3次。一般用药2－3天控制病情，5－6天病株迅速康复。如在上述混合液中加新高脂膜和杀虫剂，防效更好。同时防治褐纹病，绵疫病等病害。