水稻坐蔸防治上应采取因田制宜，预防为主，综合防治的策略。
预防措施。在培育壮秧的基础上，应针对易发生水稻坐蔸的田块和烂泥田、冷浸田等，着重改善秧苗的生长环境，浅水栽秧，浅插秧，并注意氮、磷、钾、微肥的比例。
1、预防缺钾缺锌引起水稻坐蔸。施底肥时，注意氮、磷、钾、锌肥的比例，亩增施氯化钾7.5公斤、硫酸锌1.5-2公斤。
2、预防根部中毒引起水稻坐蔸。对于烂泥田、冷浸田等，可在栽秧前亩施草木灰50公斤、石灰15-20公斤，以中和硫化氢、有机酸等有害物质，提高泥温，改善秧苗根部生长环境。
3、浅水插秧。做到寸水活苗，浅水促蘖。深水、深插、泥温低，影响秧苗对营养物质的吸收。故须实行浅水栽秧，以增强光照，提高水温和泥温，加速肥料分解，以提高根系的吸收利用率，促进秧苗健壮生长。