蔬菜防治土传病害要以“预防为主、综合防治”为方针，利用大棚设施栽培的优势，改善栽培条件，营造不利于土传病害病原菌生存和浸染的环境，并结合科学、合理、、有效的药剂防治，有效抑制和减轻土传病害的发生和危害。
严格实行轮作：实践证明，轮作是防治土传病害经济有效的措施。茄科、葫芦科作物与十字花科或豆科作物实施轮作，效果较明显；十字花科作物与葱、韭、蒜类轮作，效果也较显著。
实行土壤：棚地翻耕、整畦前或移栽秧苗前，进行土壤，可每亩用50%多菌灵可湿性粉剂2.5~3公斤，撒施于土表后翻耕、做畦。也可每亩用立枯净、立枯宁、敌克松、甲基硫菌灵可湿性粉剂2~3克，撒施或喷雾。
实行营养钵育苗合理配制好营养土，在营养土装钵后待用时，用30%瑞苗清水剂2000~2500倍液喷淋营养土，待茄子等的幼苗有2~3片真叶时及时假植进钵，待黄瓜等子叶展开返青时及时顶苗进钵。在小拱棚上覆盖薄膜和遮阳网。覆盖3~5天，然后日盖夜揭。控制好苗床的温、湿度，培育壮苗。壮苗标准是茎短粗、节间紧密、叶大而厚、叶色浓绿、根系粗壮。
实行深翻土将大棚内土壤深翻25厘米左右，然后暴晒3~5天，以风化土壤、高温，改善土壤环境，使作物根深叶茂，增强作物抗病能力。