小麦种处理的目的不同，，方法也不同，现介绍如下：
一、防治病害
1.变温浸种。先将麦种用冷水预浸4~6小时，捞出用52~55℃温水浸l~2分钟，使种子温度达到50℃，再捞出放入56℃温水中，保持水温55℃，浸5分钟取出，用凉水冷却后晾干播种，对预防小麦散黑穗病效果很好，但必须严格控制温度和时间。
2.恒温浸种。将麦种放入50~55℃热水中，立即搅拌，使水温迅速降至45℃，在此温度下浸3小时取出，冷却后晾干播种，可以有效地防治小麦散黑穗病、赤霉病、颖枯病等。
3.石灰水浸种。先用50千克水溶解0.5千克优质生石灰，除去渣滓后浸入选好的麦种，使水面高出种子l0~15厘米，并保持静置，不能搅动水面；浸泡时间视气温而定：在气温为20℃时浸泡3~5天，25℃时浸泡2~3天，30℃时仅需要l天。浸泡好的麦种不需用清水冲冼，摊开晾干后即可播种，对预防小麦散黑穗病、杆黑粉病、赤霉病、颖枯病、叶枯病等，均有良好的效果。
4.萎锈灵拌种。用有效成分为75%的萎锈灵可湿性粉剂按种子量的0.3%拌种，可以有效地防治小麦散黑穗病，并能兼治小麦种子上或土壤中的小麦腥黑穗病和杆黑粉病。
5.粉锈宁拌种。粉锈宁是一种新型、、内吸性剂，对小麦多种病害有。据试验，用20%粉锈宁乳油按种子量的0.08~0.1%拌种，可以防治小麦散黑穗病、腥黑穗病和杆黑粉病；按种子量的0.2%拌种，可以防治小麦锈病、白粉病和纹枯病；按种子量的0.3%拌种，可以防治小麦全蚀病和根腐病等。
二、防治地下害虫
6.甲基异柳磷或辛硫磷拌种。用50%辛硫磷乳油100毫升，对水2~3千克，拌麦种50千克，拌匀后堆闷2~3小时，对蝼蛄、蛴螬、金针虫等害虫有。