小麦苗期有很多容易发生的病害，主要应预防小麦多种病害。小麦苗期也是防病害的时期。
今年小麦后期出现点片白穗的地块，以及叶片过早发黄的地块都要注意防治。小麦全蚀病、根腐病、纹枯病都是典型的土传病害，要想控制病害必须以预防为主。尤其全蚀病，虽然以小麦生长后期发病为主，但播种环节及苗期是防治的时机。
具体措施上要注意：
①土壤处理：每亩用70%甲基硫菌灵可湿性粉剂2公斤，或50%多菌灵可湿性粉剂2~3公斤，拌细土30公斤，撒于地表，然后整地播种，局部发病时可以对发病中心周围重点施药。
②种子处理：小麦播前用12.5%全蚀净悬浮剂20毫升，拌种10公斤，拌后晾干播种。
③冬前药剂灌根：小麦播种后1个月左右，用15%三唑酮300倍液，将喷雾器拧掉喷头，顺垄灌根，要使药液渗入小麦根部，药液量要达到每亩75公斤。要注意灌根前后的几天内尽量不要浇水。