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微肥直接施在种子上有利于减省时间，也能够提前防治种子病虫害。
拌种：先将定量的微肥用水溶解配成稀溶液(一般浓度在0.02%～0.1%之间),再将微肥溶液放入喷雾器或喷壶中,用喷雾器喷施在种子上,边喷边搅拌,使每粒种子均匀沾满肥液,溶液也不宜过多,以免种皮起皱,造成烂种。拌好后将种子摊开晾干即可播种。
浸种：以玉米为例,先将一水(或七水)硫酸锌溶解,制成浓度为0.02%～0.05%的溶液,然后浸泡种子6～8小时,种子捞出后稍微晾干即可播种。硫酸锌溶液浓度如果大于0.1%会影响种子发芽。采用浸种施肥的方法要求播种地的土壤墒情良好,一般在黄墒以上才好；如果土壤干旱,达到了灰墒程度,那么播后种子周围的土壤会消耗大量水分而影响出苗。
种子包衣：将微量元素肥料和添加调节剂配成一定黏度的溶液,在包衣机中滚动包裹一定时间烘干即可播种。