枸杞剪枝应严格把关。
1、秋剪枝：时间为10月中旬至11月中旬，按三去三留的要求，剪除非生产性的枝条，更新结果枝。这样可增加植株营养贮备，提高下年结果量。
2、春剪枝：时间为3月下旬至4月上旬，主要是弥补上年秋剪枝不足，剪足冬季干枯的和带刺的枝条，枝条密的要疏剪，进一步完善树冠内部的光照条件。对二年生的枸杞，春剪一年生的枝条时，主枝留长30～40厘米，侧枝留长20厘米左右，主侧枝上有空隙处的小枝条留长8～10厘米，空隙较大处的枝条结果率的关键，主要是选留二年生枝条。主侧枝留长40～50厘米，小枝留长20～30厘米。侧枝上每隔15厘米左右留一小枝，培养结果枝组。通过修剪的植株，树冠已定形。
3、夏剪枝：时间为6～8月，主要剪去剪口、锯口下和主枝、主干上、根部的萌芽、根蘖及徒长枝，以减少营养消耗。但要注意保留补充空间用的辅助结果枝，以作主枝。当新定植的枸杞发出二次枝，老枸杞新发出的枝条，在长到40～60厘米时，或在树冠空间生出的枝条长到20～30厘米时，应及时摘心剪梢；对周围长出多余的枝条要提前抹芽除萌，使营养集中，促进树冠内外开花立体结果。也促使这些枝条中下部发出较多的新枝条，培养更多的结果枝组，这对提高枸杞当年产量效果明显。对延长枸杞结果年限有很好的作用。